ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: intron 13 C/T (-13910 ) SNP

Locus Name: MCM6 minichromosome maintenance deficient 6


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Mozambican
(SA001668V) 
94
(5/17/2006) 
N.A0.990 0.010 
Africa South African
(SA004127O) 
124
(9/21/2012) 
N.A0.782 0.218 
Africa Xhosa
(SA004126N) 
218
(9/21/2012) 
N.A1.000 
Africa Ashanti
(SA004128P) 
392
(9/21/2012) 
N.A1.000 
Africa Dogon
(SA003548U) 
158
(2/16/2011) 
N.A0.994 0.006 
Africa Fulani
(SA001667U) 
102
(5/17/2006) 
N.A0.790 0.210 
Africa Fulani
(SA002055M) 
182
(3/8/2007) 
N.A0.610 0.390 
Africa Fulani
(SA002055M) 
126
(3/9/2007) 
N.A0.611 0.389 
Africa Fulani
(SA003549V) 
324
(2/16/2011) 
N.A0.630 0.370 
Africa Fulani
(SA004148R) 
98
(10/12/2012) 
N.A0.888 0.112 
Africa Hausa
(SA004149S) 
36
(10/12/2012) 
N.A0.861 0.139 
Africa Mambila
(SA004150K) 
244
(10/12/2012) 
N.A0.996 0.004 
Africa Sao Tomeans
(SA001666T) 
284
(5/17/2006) 
N.A0.960 0.040 
Africa Woloff, Senegal
(SA004151L) 
138
(10/12/2012) 
N.A1.000 
Africa Beni Amir
(SA002047N) 
200
(3/8/2007) 
N.A0.995 0.005 
Africa Beni Amir
(SA002047N) 
164
(3/9/2007) 
N.A0.994 0.006 
Africa Jaali
(SA002050H) 
192
(3/8/2007) 
N.A0.995 0.005 
Africa Jaali
(SA002050H) 
176
(3/9/2007) 
N.A0.994 0.006 
Africa Jaali
(SA004153N) 
60
(10/12/2012) 
N.A1.000 
Africa Shaigi
(SA004154O) 
22
(10/12/2012) 
N.A1.000 
Africa Manjak
(SA004152M) 
186
(10/12/2012) 
N.A1.000 
Asia Arabs
(SA002041H) 
166
(3/8/2007) 
N.A0.976 0.024 
Asia Arabs
(SA002041H) 
162
(3/9/2007) 
N.A0.975 0.025 
Asia Bedouin
(SA002043J) 
38
(3/8/2007) 
N.A0.974 0.026 
Asia Bedouin
(SA002046M) 
52
(3/8/2007) 
N.A0.942 0.058 
Asia Bedouin
(SA002043J) 
38
(3/9/2007) 
N.A0.974 0.026 
Asia Bedouin
(SA002046M) 
46
(3/9/2007) 
N.A0.935 0.065 
Asia Druze
(SA002042I) 
28
(3/8/2007) 
N.A0.964 0.036 
Asia Druze
(SA002042I) 
28
(3/9/2007) 
N.A0.964 0.036 
Asia Palestinian
(SA002044K) 
38
(3/8/2007) 
N.A0.974 0.026 
Asia Palestinian
(SA002044K) 
36
(3/9/2007) 
N.A0.972 0.028 
Europe Austrian
(SA004147Q) 
188
(10/12/2012) 
N.A0.470 0.530 
Europe Basque
(SA004142L) 
376
(10/12/2012) 
N.A0.402 0.598 
Europe Canarian
(SA004143M) 
1102
(10/12/2012) 
N.A0.635 0.365 
Europe Danes
(SA004122J) 
316
(9/21/2012) 
N.A0.212 0.788 
Europe Dutch
(SA004119P) 
90
(9/21/2012) 
N.A0.344 0.656 
Europe Estonian
(SA003842R) 
710
(10/7/2011) 
N.A0.486 0.514 
Europe Europeans, Northern
(SA004120H) 
708
(9/21/2012) 
N.A0.298 0.702 
Europe Finns
(SA004129Q) 
946
(9/21/2012) 
N.A0.173 0.827 
Europe French
(SA002057O) 
48
(3/8/2007) 
N.A0.542 0.458 
Europe Germans
(SA004118O) 
868
(9/21/2012) 
N.A0.437 0.563 
Europe Greeks
(SA004115L) 
40
(9/21/2012) 
N.A0.925 0.075 
Europe Hungarian
(SA003841Q) 
362
(10/7/2011) 
N.A0.641 0.359 
Europe Irish
(SA004155P) 
94
(10/12/2012) 
N.A0.128 0.872 
Europe Italians
(SA001665S) 
134
(5/17/2006) 
N.A0.870 0.130 
Europe Italians
(SA002058P) 
58
(3/8/2007) 
N.A0.897 0.103 
Europe Italians
(SA004116M) 
216
(9/21/2012) 
N.A0.829 0.171 
Europe Nenets
(SA004157R) 
178
(10/12/2012) 
N.A0.927 0.073 
Europe Nenets
(SA004158S) 
176
(10/12/2012) 
N.A0.733 0.267 
Europe Poles
(SA004145O) 
592
(10/12/2012) 
N.A0.561 0.439 
Europe Portuguese
(SA001664R) 
180
(5/17/2006) 
N.A0.630 0.370 
Europe Russians
(SA002628S) 
224
(6/30/2008) 
N.A0.730 0.270 
Europe Russians
(SA002629T) 
228
(6/30/2008) 
N.A0.740 0.260 
Europe Russians
(SA002630L) 
52
(6/30/2008) 
N.A0.650 0.350 
Europe Sami
(SA003335O) 
62
(10/12/2012) 
N.A0.695 0.305 
Europe Spaniards
(SA004117N) 
304
(9/21/2012) 
N.A0.464 0.536 
Europe Swedes
(SA004121I) 
464
(9/21/2012) 
N.A0.250 0.750 
Europe Swedes
(SA004130I) 
3346
(9/21/2012) 
N.A0.069 0.931 
Europe Swedes
(SA004146P) 
194
(10/12/2012) 
N.A0.268 0.732 
Europe Szekely (Seklers)
(SA003846V) 
130
(10/7/2011) 
N.A0.600 0.400 
Europe Udmurt
(SA002632N) 
188
(6/30/2008) 
N.A0.740 0.260 
Asia Indian, Mixed
(SA004144N) 
462
(10/12/2012) 
N.A0.775 0.225 
Asia Kazakh
(SA003839X) 
166
(10/7/2011) 
N.A0.900 0.100 
Asia Komi-Permyaks
(SA002633O) 
138
(6/30/2008) 
N.A0.640 0.360 
Asia Pamirian
(SA002634P) 
68
(6/30/2008) 
N.A0.930 0.070 
Asia Uzbek
(SA003840P) 
200
(10/7/2011) 
N.A0.834 0.166 
Asia Andamanese
(SA003837V) 
32
(9/16/2011) 
N.A0.969 0.031 
Asia Badaga
(SA003829W) 
172
(9/16/2011) 
N.A0.767 0.233 
Asia Baiga
(SA003802N) 
40
(9/16/2011) 
N.A0.975 0.025 
Asia Bengali
(SA003805Q) 
58
(9/16/2011) 
N.A0.931 0.069 
Asia Bhil
(SA003806R) 
60
(9/16/2011) 
N.A0.833 0.167 
Asia Bhil
(SA003809U) 
30
(9/16/2011) 
N.A0.833 0.167 
Asia Brahmin
(SA003811N) 
118
(9/16/2011) 
N.A0.720 0.280 
Asia Brahmin
(SA003812O) 
50
(9/16/2011) 
N.A0.760 0.240 
Asia Brahmin
(SA003816S) 
30
(9/16/2011) 
N.A0.800 0.200 
Asia Brahmin
(SA003823Q) 
20
(9/16/2011) 
N.A0.950 0.050 
Asia Brahmin
(SA003830O) 
40
(9/16/2011) 
N.A0.925 0.075 
Asia Chakali
(SA003828V) 
62
(9/16/2011) 
N.A0.968 0.032 
Asia Chamar
(SA003813P) 
20
(9/16/2011) 
N.A0.950 0.050 
Asia Gadaba
(SA003803O) 
42
(9/16/2011) 
N.A0.976 0.024 
Asia Garo
(SA003818U) 
38
(9/16/2011) 
N.A0.947 0.053 
Asia Ho
(SA003799C) 
36
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Irula
(SA003831P) 
64
(9/16/2011) 
N.A0.984 0.016 
Asia Jats
(SA003807S) 
90
(9/16/2011) 
N.A0.533 0.467 
Asia Korku
(SA003808T) 
90
(9/16/2011) 
N.A0.978 0.022 
Asia Kotas
(SA003832Q) 
74
(9/16/2011) 
N.A0.865 0.135 
Asia Kshatriya
(SA003814Q) 
28
(9/16/2011) 
N.A0.750 0.250 
Asia Kurumba
(SA003833R) 
174
(9/16/2011) 
N.A0.988 0.012 
Asia Lingayat
(SA003834S) 
38
(9/16/2011) 
N.A0.895 0.105 
Asia Mala
(SA003824R) 
32
(9/16/2011) 
N.A0.937 0.063 
Asia Mizo
(SA003819V) 
26
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Munda
(SA003800L) 
18
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Naga
(SA003820N) 
56
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Naga
(SA003821O) 
28
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Naga
(SA003822P) 
44
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Oraon
(SA003804P) 
58
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Sahariya
(SA003817T) 
36
(9/16/2011) 
N.A0.917 0.083 
Asia Santal
(SA003801M) 
28
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Tharu
(SA003810M) 
40
(9/16/2011) 
N.A0.900 0.100 
Asia Tharu
(SA003815R) 
114
(9/16/2011) 
N.A0.886 0.114 
Asia Thoti
(SA003825S) 
22
(9/16/2011) 
N.A0.955 0.045 
Asia Toda
(SA003835T) 
110
(9/16/2011) 
N.A0.555 0.445 
Asia Vellala
(SA003826T) 
48
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Asia Vysya
(SA003827U) 
34
(9/16/2011) 
N.A0.941 0.059 
Asia Yadava
(SA003836U) 
60
(9/16/2011) 
N.A0.967 0.033 
EastAsia Japanese
(SA003845U) 
106
(10/7/2011) 
N.A1.000 
Asia Tibetan
(SA004156Q) 
990
(10/12/2012) 
N.A1.000 
Asia Onge
(SA003838W) 
16
(9/16/2011) 
N.A1.000 
Siberia Chukchi
(SA002631M) 
70
(6/30/2008) 
N.A0.940 0.060 
SouthAmerica Brazilian
(SA003843S) 
798
(10/7/2011) 
N.A0.753 0.247 
SouthAmerica Brazilian
(SA003844T) 
100
(10/7/2011) 
N.A0.880 0.120 
SouthAmerica Brazilian
(SA004159T) 
774
(10/12/2012) 
N.A0.705 0.295 
SouthAmerica Brazilian
(SA004160L) 
364
(10/12/2012) 
N.A0.816 0.184 
SouthAmerica Brazilian
(SA004161M) 
400
(10/12/2012) 
N.A0.825 0.175 
SouthAmerica Brazilian
(SA004162N) 
524
(10/12/2012) 
N.A0.796 0.204 
SouthAmerica Chilean
(SA004124L) 
512
(9/21/2012) 
N.A0.777 0.223 
SouthAmerica Colombian
(SA004123K) 
256
(9/21/2012) 
N.A0.900 0.100 
SouthAmerica Guarani
(SA004163O) 
168
(10/12/2012) 
N.A0.994 0.006 
SouthAmerica Guarani
(SA004164P) 
118
(10/12/2012) 
N.A0.924 0.076 
SouthAmerica Kaingang
(SA004165Q) 
144
(10/12/2012) 
N.A0.951 0.049 
SouthAmerica Mapuche
(SA004125M) 
86
(9/21/2012) 
N.A0.942 0.058 
SouthAmerica Xavante
(SA004166R) 
202
(10/12/2012) 
N.A0.995 0.005 

Total Population Samples 122
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan