ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: 5-site haplotype (rs5746849,rs740603,rs4646312,rs165722,rs6269)

Locus Name: Catechol-O-methyltransferase


Geographic
Region		Population
(Sample UID)		Typed Sample
Size(2N)
(Entry Date)		Add.
info		Genotype
info		Allele Symbol
A-A-C-C-GA-A-C-T-AA-A-C-T-GA-A-T-C-AA-A-T-C-GA-A-T-T-AA-A-T-T-GA-G-C-C-AA-G-C-C-GA-G-C-T-AA-G-T-C-AA-G-T-C-GA-G-T-T-AG-A-C-C-GG-A-T-C-AG-A-T-C-GG-A-T-T-AG-A-T-T-GG-G-C-C-AG-G-C-C-GG-G-C-T-AG-G-C-T-GG-G-T-C-AG-G-T-C-GG-G-T-T-AG-G-T-T-G
Africa Biaka
(SA000005F) 		136
(12/7/2007) 		 N.A0.009 0 0 0.133 0.039 0.114 0 0 0 0 0 0 0.029 0 0 0.024 0.011 0 0 0.013 0 0 0.315 0.150 0.162 0 
Africa Hausa
(SA000100B) 		72
(12/7/2007) 		 N.A0.037 0 0 0 0.120 0.334 0 0 0 0 0 0.015 0 0 0.045 0.053 0.017 0 0 0.032 0 0 0.080 0.034 0.232 0 
Africa Ibo
(SA000099S) 		96
(12/7/2007) 		 N.A0.082 0 0 0 0.034 0.297 0 0 0 0 0.011 0.013 0 0 0.063 0 0.055 0 0 0.032 0 0 0.083 0.130 0.200 0 
Africa Mbuti
(SA000006G) 		78
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.089 0.233 0.025 0.027 0 0 0 0 0 0 0 0 0.102 0.027 0.023 0 0.013 0 0 0.255 0 0.206 0 
Africa Yoruba
(SA000036J) 		156
(12/7/2007) 		 N.A0.054 0 0 0 0.111 0.320 0 0 0 0 0 0 0 0 0.070 0.078 0.020 0 0 0.016 0 0 0.116 0.067 0.147 0 
Africa Chagga
(SA000487T) 		88
(12/7/2007) 		 N.A0.041 0 0 0 0.154 0.213 0 0 0.012 0 0 0 0 0 0.051 0.024 0.016 0 0 0.083 0 0 0.051 0.140 0.214 0 
Africa Jews, Ethiopian
(SA000015G) 		60
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.016 0.095 0.272 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.233 0 0 0 0.055 0.328 0 
Africa Masai
(SA000854R) 		40
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0 0.191 0.234 0 0 0 0 0 0 0 0 0.073 0 0.052 0 0 0.200 0 0 0.027 0.034 0.189 0 
Africa Sandawe
(SA001773S) 		80
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.038 0.037 0.235 0 0 0.039 0 0 0 0 0 0.072 0 0.017 0 0 0.049 0 0 0.069 0.159 0.256 0.029 
Africa African Americans
(SA000101C) 		180
(12/7/2007) 		 N.A0.047 0 0.007 0.063 0.105 0.254 0 0 0 0 0 0 0.008 0 0.027 0.037 0.027 0 0 0.129 0 0 0.050 0.030 0.210 0.006 
Asia Druze
(SA000047L) 		204
(12/7/2007) 		 N.A0.069 0 0 0.032 0.029 0.306 0 0 0.005 0 0 0 0 0 0.010 0 0 0 0 0.279 0.005 0 0.081 0 0.179 0.005 
Asia Jews, Yemenite
(SA000016H) 		86
(12/7/2007) 		 N.A0.014 0 0 0.023 0 0.301 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.521 0 0 0.059 0 0.083 0 
Europe Samaritans
(SA000098R) 		82
(12/7/2007) 		 N.A0.057 0 0.025 0 0 0.320 0 0 0.007 0 0 0 0.044 0.012 0 0 0 0 0 0.484 0 0 0.025 0 0.026 0 
Europe Adygei
(SA000017I) 		108
(12/7/2007) 		 N.A0.051 0 0 0.057 0.009 0.244 0 0 0 0 0 0 0 0 0.005 0 0.005 0 0 0.523 0 0 0.009 0 0.097 0 
Europe Chuvash
(SA000491O) 		82
(12/7/2007) 		 N.A0.075 0 0 0.207 0 0.352 0 0 0 0 0 0 0.012 0 0 0 0 0 0 0.169 0 0 0 0 0.184 0 
Europe Danes
(SA000007H) 		102
(12/7/2007) 		 N.A0.104 0 0 0.032 0 0.403 0 0 0 0 0.007 0 0.032 0 0 0 0 0 0 0.229 0 0 0.029 0 0.163 0 
Europe Europeans, Mixed
(SA000020C) 		184
(12/7/2007) 		 N.A0.067 0 0 0.015 0.016 0.397 0 0 0 0 0.020 0 0 0 0.012 0 0 0 0.005 0.205 0.006 0 0.052 0 0.204 0 
Europe Finns
(SA000018J) 		70
(12/7/2007) 		 N.A0.082 0 0 0.229 0 0.404 0 0 0 0 0 0 0 0 0.014 0 0 0 0 0.147 0 0 0 0 0.125 0 
Europe Hungarian
(SA002023H) 		172
(12/7/2007) 		 N.A0.024 0 0.008 0.091 0 0.435 0.006 0 0.006 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.264 0 0 0.039 0 0.127 0 
Europe Irish
(SA000057M) 		228
(12/7/2007) 		 N.A0.070 0 0 0.051 0.013 0.361 0 0 0.003 0 0 0 0.015 0 0 0 0.014 0 0 0.313 0 0 0.050 0 0.110 0 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA000490N) 		162
(12/7/2007) 		 N.A0.008 0 0 0.084 0.006 0.303 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.394 0 0 0.021 0 0.185 0 
Europe Russians
(SA000019K) 		96
(12/7/2007) 		 N.A0.110 0 0 0.089 0 0.351 0 0 0 0 0 0 0.043 0 0 0 0.043 0 0 0.244 0 0 0.027 0.010 0.081 0 
Europe Russians
(SA001530J) 		64
(12/7/2007) 		 N.A0.053 0.013 0 0.094 0 0.329 0 0.006 0 0.018 0 0 0.049 0 0 0 0 0.016 0.026 0.275 0 0 0 0 0.121 0 
Asia Khanty
(SA000488U) 		100
(12/7/2007) 		 N.A0.023 0 0 0.187 0 0.310 0 0 0 0 0 0 0.020 0 0 0 0.010 0 0 0.337 0 0 0.033 0 0.080 0 
Asia Komi-Zyrian
(SA000489V) 		94
(12/7/2007) 		 N.A0.013 0 0 0.094 0.011 0.233 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.487 0 0 0.013 0 0.150 0 
EastAsia Ami
(SA000002C) 		80
(12/7/2007) 		 N.A0.105 0 0 0.560 0 0.160 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.133 0 0 0.040 0 0.002 0 
EastAsia Atayal
(SA000021D) 		82
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.685 0 0.156 0 0 0.012 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.024 0 0 0.095 0 0.027 0 
EastAsia Han
(SA000001B) 		100
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0.011 0.408 0 0.258 0 0 0 0 0 0 0.021 0 0 0 0.012 0 0 0.199 0 0 0.073 0 0.018 0 
EastAsia Han
(SA000009J) 		108
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.373 0 0.201 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.306 0 0 0.059 0 0.061 0 
EastAsia Japanese
(SA000010B) 		92
(12/7/2007) 		 N.A0.052 0 0 0.405 0 0.293 0 0 0 0 0 0 0 0 0.011 0 0 0 0 0.122 0 0 0.095 0 0.022 0 
EastAsia Koreans
(SA000936S) 		108
(12/7/2007) 		 N.A0.062 0 0 0.373 0 0.213 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.253 0 0 0.089 0 0 0.009 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA000022E) 		50
(12/7/2007) 		 N.A0.029 0 0 0.225 0 0.264 0 0 0.029 0 0.032 0 0 0 0.020 0 0 0 0.020 0.202 0 0 0.142 0 0.035 0 
EastAsia Hakka
(SA000003D) 		82
(12/7/2007) 		 N.A0.026 0 0 0.413 0 0.159 0 0 0 0 0.012 0 0 0 0 0 0.012 0 0 0.316 0 0 0.062 0 0 0 
Asia Lao Loum
(SA001853R) 		230
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.418 0.004 0.160 0 0 0 0 0.048 0.005 0 0 0 0 0 0 0 0.252 0 0 0.052 0 0.061 0 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA000012D) 		46
(12/7/2007) 		 N.A0.091 0 0 0.366 0 0.239 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.257 0 0 0.047 0 0 0 
Oceania Micronesians
(SA000063J) 		72
(12/7/2007) 		 N.A0.114 0 0 0.412 0 0.099 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.261 0 0 0.018 0 0.095 0 
Siberia Yakut
(SA000011C) 		100
(12/7/2007) 		 N.A0.033 0 0 0.283 0 0.284 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.327 0 0 0.037 0 0.036 0 
NorthAmerica Cheyenne
(SA000023F) 		112
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.438 0 0.321 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.161 0 0 0.080 0 0 0 
NorthAmerica Pima, Arizona
(SA000025H) 		102
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.784 0 0.167 0 0 0 0 0 0 0 0.010 0 0 0 0 0 0 0 0 0.039 0 0 0 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA000026I) 		106
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.576 0 0.330 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.085 0 0 0.009 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA000013E) 		96
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.305 0 0.549 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.083 0 0 0.039 0 0.023 0 
SouthAmerica Karitiana
(SA000028K) 		104
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.538 0.010 0.019 0 0 0 0 0.010 0 0 0 0.010 0 0 0 0 0.356 0 0 0.048 0 0.010 0 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 		46
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.478 0 0.391 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.022 0 0 0 0.022 0 0 0.065 0.022 0 0 
SouthAmerica Surui
(SA000014F) 		90
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.633 0 0.311 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.011 0 0.011 0.033 0 0 0 
SouthAmerica Ticuna
(SA000027J) 		130
(12/7/2007) 		 N.A0 0 0 0.633 0 0.182 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.136 0 0.049 0 

Total Population Samples 45
Total Alleles: 26

© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan