ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs1404784

Locus Name: VPS10 domain receptor protein SORCS 3


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(5/18/2009) 
N.A0.690 0.310 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(5/18/2009) 
N.A0.500 0.500 
Africa San
(SA001469U) 
12
(5/18/2009) 
N.A0.580 0.420 
Africa Biaka
(SA000005F) 
126
(3/5/2008) 
N.A0.056 0.944 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(5/18/2009) 
N.A0.060 0.940 
Africa Hausa
(SA000100B) 
68
(3/5/2008) 
N.A0.397 0.603 
Africa Ibo
(SA000099S) 
90
(3/5/2008) 
N.A0.489 0.511 
Africa Lisongo
(SA002770Q) 
16
(11/18/2011) 
N.A0.500 0.500 
Africa Mbuti
(SA000006G) 
72
(3/5/2008) 
N.A0.056 0.944 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(5/18/2009) 
N.A0.070 0.930 
Africa Yoruba
(SA000036J) 
154
(3/5/2008) 
N.A0.442 0.558 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.460 0.540 
Africa Chagga
(SA000487T) 
88
(3/5/2008) 
N.A0.421 0.580 
Africa Jews, Ethiopian
(SA000015G) 
64
(3/5/2008) 
N.A0.422 0.578 
Africa Masai
(SA000854R) 
38
(3/5/2008) 
N.A0.316 0.684 
Africa Sandawe
(SA001773S) 
80
(3/5/2008) 
N.A0.575 0.425 
Africa Zaramo
(SA002586V) 
78
(11/18/2011) 
N.A0.450 0.550 
Africa African Americans
(SA000101C) 
168
(3/5/2008) 
N.A0.506 0.494 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.330 0.670 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(5/18/2009) 
N.A0.700 0.300 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(5/18/2009) 
N.A0.660 0.340 
Asia Druze
(SA000047L) 
200
(3/5/2008) 
N.A0.725 0.275 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(5/18/2009) 
N.A0.730 0.270 
Asia Jews, Yemenite
(SA000016H) 
86
(3/5/2008) 
N.A0.605 0.395 
Asia Kuwaiti
(SA002765U) 
32
(11/18/2011) 
N.A0.810 0.190 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
Europe Samaritans
(SA000098R) 
78
(3/5/2008) 
N.A0.731 0.269 
Europe Adygei
(SA000017I) 
108
(3/5/2008) 
N.A0.778 0.222 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(5/18/2009) 
N.A0.760 0.240 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.650 0.350 
Europe Chuvash
(SA000491O) 
80
(3/5/2008) 
N.A0.813 0.188 
Europe Danes
(SA000007H) 
98
(3/5/2008) 
N.A0.745 0.255 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1952
(11/18/2009) 
N.A0.838 0.162 
Europe Europeans, Mixed
(SA000020C) 
170
(3/5/2008) 
N.A0.777 0.224 
Europe Finns
(SA000018J) 
70
(3/5/2008) 
N.A0.771 0.229 
Europe French
(SA001503J) 
58
(5/18/2009) 
N.A0.760 0.240 
Europe Hungarian
(SA002023H) 
178
(3/5/2008) 
N.A0.787 0.214 
Europe Irish
(SA000057M) 
228
(3/5/2008) 
N.A0.829 0.171 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(5/18/2009) 
N.A0.770 0.230 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA000490N) 
160
(3/5/2008) 
N.A0.763 0.238 
Europe Jews, Sephardic
(SA000096P) 
50
(11/18/2011) 
N.A0.540 0.460 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(5/18/2009) 
N.A0.880 0.130 
Europe Russians
(SA000019K) 
96
(3/5/2008) 
N.A0.740 0.260 
Europe Russians
(SA001530J) 
66
(3/5/2008) 
N.A0.864 0.136 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.800 0.200 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(5/18/2009) 
N.A0.730 0.270 
Europe Sardinian
(SA002768X) 
70
(11/18/2011) 
N.A0.660 0.340 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.860 0.140 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.920 0.080 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(5/18/2009) 
N.A0.910 0.090 
Asia Khanty
(SA000488U) 
98
(3/5/2008) 
N.A0.939 0.061 
Asia Komi-Zyrian
(SA000489V) 
94
(3/5/2008) 
N.A0.755 0.245 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.850 0.150 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.920 0.080 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.800 0.200 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.740 0.260 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.880 0.130 
Asia Keralite
(SA001854S) 
60
(11/18/2011) 
N.A0.920 0.080 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
Asia Thoti
(SA000077O) 
28
(11/18/2011) 
N.A0.710 0.290 
EastAsia Ami
(SA000002C) 
76
(3/5/2008) 
N.A0.816 0.184 
EastAsia Atayal
(SA000021D) 
80
(3/5/2008) 
N.A0.975 0.025 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Han
(SA000001B) 
94
(3/5/2008) 
N.A0.734 0.266 
EastAsia Han
(SA000009J) 
106
(3/5/2008) 
N.A0.906 0.094 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Japanese
(SA000010B) 
100
(3/5/2008) 
N.A0.910 0.090 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(5/18/2009) 
N.A0.930 0.070 
Asia Kachari
(SA000040E) 
34
(11/18/2011) 
N.A0.820 0.180 
EastAsia Koreans
(SA000936S) 
108
(3/5/2008) 
N.A0.917 0.083 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/17/2009) 
N.A0.917 0.083 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.610 0.390 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(5/18/2009) 
N.A1.000 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(5/18/2009) 
N.A1.000 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA000022E) 
50
(3/5/2008) 
N.A0.780 0.220 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(5/18/2009) 
N.A0.680 0.320 
EastAsia Hakka
(SA000003D) 
82
(3/5/2008) 
N.A0.842 0.159 
Asia Lao Loum
(SA001853R) 
238
(3/5/2008) 
N.A0.786 0.214 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(5/18/2009) 
N.A0.820 0.180 
Oceania Papuan New Guinean
(SA000084M) 
44
(11/18/2011) 
N.A0.770 0.230 
Oceania Samoans
(SA000072J) 
18
(11/18/2011) 
N.A0.940 0.060 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA000012D) 
46
(3/5/2008) 
N.A0.804 0.196 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(5/18/2009) 
N.A0.870 0.130 
Oceania Micronesians
(SA000063J) 
68
(3/5/2008) 
N.A0.809 0.191 
Siberia Yakut
(SA000011C) 
100
(3/5/2008) 
N.A0.890 0.110 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.880 0.120 
NorthAmerica Cheyenne
(SA000023F) 
108
(3/5/2008) 
N.A0.991 0.009 
NorthAmerica Pima, Arizona
(SA000025H) 
100
(3/5/2008) 
N.A1.000 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA000026I) 
106
(3/5/2008) 
N.A1.000 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(5/18/2009) 
N.A1.000 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA000013E) 
92
(3/5/2008) 
N.A0.989 0.011 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.980 0.020 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(5/18/2009) 
N.A1.000 
SouthAmerica Guihiba
(SA000055K) 
26
(11/18/2011) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA000028K) 
110
(3/5/2008) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(5/18/2009) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(3/5/2008) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA000014F) 
88
(3/5/2008) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(5/18/2009) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA000027J) 
122
(3/5/2008) 
N.A1.000 

Total Population Samples 110
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan