ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs719804

Locus Name: Tetratricopeptide repeat domain 12


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(5/18/2009) 
N.A0.960 0.040 
Africa San
(SA001469U) 
12
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
Africa Biaka
(SA000005F) 
136
(3/5/2008) 
N.A0.772 0.228 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(5/18/2009) 
N.A0.730 0.270 
Africa Hausa
(SA000100B) 
78
(3/5/2008) 
N.A0.769 0.231 
Africa Ibo
(SA000099S) 
96
(3/5/2008) 
N.A0.802 0.198 
Africa Mbuti
(SA000006G) 
78
(3/5/2008) 
N.A0.654 0.346 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(5/18/2009) 
N.A0.730 0.270 
Africa Yoruba
(SA000036J) 
156
(3/5/2008) 
N.A0.776 0.224 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.790 0.210 
Africa Chagga
(SA000487T) 
90
(3/5/2008) 
N.A0.811 0.189 
Africa Jews, Ethiopian
(SA000015G) 
60
(3/5/2008) 
N.A0.867 0.133 
Africa Masai
(SA000854R) 
40
(3/5/2008) 
N.A0.775 0.225 
Africa African Americans
(SA000101C) 
182
(3/5/2008) 
N.A0.571 0.429 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.810 0.190 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(5/18/2009) 
N.A0.720 0.280 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(5/18/2009) 
N.A0.810 0.190 
Asia Druze
(SA000047L) 
206
(3/5/2008) 
N.A0.714 0.286 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(5/18/2009) 
N.A0.800 0.200 
Asia Jews, Yemenite
(SA000016H) 
86
(3/5/2008) 
N.A0.791 0.209 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(5/18/2009) 
N.A0.910 0.090 
Europe Samaritans
(SA000098R) 
82
(3/5/2008) 
N.A0.988 0.012 
Europe Adygei
(SA000017I) 
108
(3/5/2008) 
N.A0.806 0.194 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(5/18/2009) 
N.A0.710 0.290 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.830 0.170 
Europe Chuvash
(SA000491O) 
84
(3/5/2008) 
N.A0.786 0.214 
Europe Danes
(SA000007H) 
102
(3/5/2008) 
N.A0.706 0.294 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1946
(11/18/2009) 
N.A0.775 0.225 
Europe Europeans, Mixed
(SA000020C) 
184
(3/5/2008) 
N.A0.766 0.234 
Europe Finns
(SA000018J) 
70
(3/5/2008) 
N.A0.500 0.500 
Europe French
(SA001503J) 
58
(5/18/2009) 
N.A0.760 0.240 
Europe Irish
(SA000057M) 
228
(3/5/2008) 
N.A0.728 0.272 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(5/18/2009) 
N.A0.810 0.190 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(5/18/2009) 
N.A0.810 0.190 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA000490N) 
162
(3/5/2008) 
N.A0.704 0.296 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(5/18/2009) 
N.A0.780 0.220 
Europe Russians
(SA000019K) 
96
(3/5/2008) 
N.A0.760 0.240 
Europe Russians
(SA001530J) 
66
(3/5/2008) 
N.A0.894 0.106 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.800 0.200 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.880 0.120 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.540 0.460 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(5/18/2009) 
N.A0.830 0.170 
Asia Khanty
(SA000488U) 
100
(3/5/2008) 
N.A0.830 0.170 
Asia Komi-Zyrian
(SA000489V) 
94
(3/5/2008) 
N.A0.745 0.255 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.700 0.300 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.740 0.260 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.840 0.160 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.850 0.150 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Ami
(SA000002C) 
78
(3/5/2008) 
N.A0.885 0.115 
EastAsia Atayal
(SA000021D) 
84
(3/5/2008) 
N.A0.786 0.214 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(5/18/2009) 
N.A1.000 
EastAsia Han
(SA000001B) 
100
(3/5/2008) 
N.A0.910 0.090 
EastAsia Han
(SA000009J) 
114
(3/5/2008) 
N.A0.895 0.105 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Japanese
(SA000010B) 
96
(3/5/2008) 
N.A0.917 0.083 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(5/18/2009) 
N.A0.910 0.090 
EastAsia Koreans
(SA000936S) 
108
(3/5/2008) 
N.A0.880 0.120 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/17/2009) 
N.A0.880 0.120 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(5/18/2009) 
N.A1.000 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(5/18/2009) 
N.A1.000 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA000022E) 
50
(3/5/2008) 
N.A0.760 0.240 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(5/18/2009) 
N.A0.730 0.270 
EastAsia Hakka
(SA000003D) 
82
(3/5/2008) 
N.A0.878 0.122 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(5/18/2009) 
N.A0.940 0.060 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA000012D) 
46
(3/5/2008) 
N.A0.739 0.261 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(5/18/2009) 
N.A0.710 0.290 
Oceania Micronesians
(SA000063J) 
74
(3/5/2008) 
N.A0.865 0.135 
Siberia Yakut
(SA000011C) 
100
(3/5/2008) 
N.A0.980 0.020 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(5/18/2009) 
N.A1.000 
NorthAmerica Cheyenne
(SA000023F) 
112
(3/5/2008) 
N.A0.196 0.804 
NorthAmerica Pima, Arizona
(SA000025H) 
102
(3/5/2008) 
N.A1.000 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA000026I) 
106
(3/5/2008) 
N.A1.000 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(5/18/2009) 
N.A1.000 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA000013E) 
96
(3/5/2008) 
N.A0.979 0.021 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.960 0.040 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(5/18/2009) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA000028K) 
102
(3/5/2008) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(5/18/2009) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(3/5/2008) 
N.A0.957 0.044 
SouthAmerica Surui
(SA000014F) 
90
(3/5/2008) 
N.A0.478 0.522 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(5/18/2009) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA000027J) 
130
(3/5/2008) 
N.A0.154 0.846 

Total Population Samples 96
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan