ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs870849

Locus Name: Lymphocyte-activation gene 3


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(5/18/2009) 
N.A0.440 0.560 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(5/18/2009) 
N.A0.540 0.460 
Africa San
(SA001469U) 
12
(5/18/2009) 
N.A0.830 0.170 
Africa Biaka
(SA000005F) 
128
(3/18/2008) 
N.A0.828 0.172 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(5/18/2009) 
N.A0.840 0.160 
Africa Hausa
(SA000100B) 
68
(3/18/2008) 
N.A0.471 0.529 
Africa Ibo
(SA000099S) 
92
(3/18/2008) 
N.A0.522 0.478 
Africa Lisongo
(SA002770Q) 
16
(11/21/2011) 
N.A0.560 0.440 
Africa Mbuti
(SA000006G) 
72
(3/18/2008) 
N.A0.681 0.319 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(5/18/2009) 
N.A0.730 0.270 
Africa Yoruba
(SA000036J) 
152
(3/18/2008) 
N.A0.533 0.467 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.520 0.480 
Africa Chagga
(SA000487T) 
88
(3/18/2008) 
N.A0.534 0.466 
Africa Jews, Ethiopian
(SA000015G) 
64
(3/18/2008) 
N.A0.500 0.500 
Africa Masai
(SA000854R) 
38
(3/18/2008) 
N.A0.605 0.395 
Africa Sandawe
(SA001773S) 
80
(3/18/2008) 
N.A0.775 0.225 
Africa Zaramo
(SA002586V) 
80
(11/21/2011) 
N.A0.640 0.360 
Africa African Americans
(SA000101C) 
168
(3/18/2008) 
N.A0.524 0.476 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.520 0.480 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(5/18/2009) 
N.A0.620 0.380 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(5/18/2009) 
N.A0.350 0.650 
Asia Druze
(SA000047L) 
198
(3/18/2008) 
N.A0.490 0.510 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(5/18/2009) 
N.A0.500 0.500 
Asia Jews, Yemenite
(SA000016H) 
86
(3/18/2008) 
N.A0.419 0.581 
Asia Kuwaiti
(SA002765U) 
32
(11/21/2011) 
N.A0.530 0.470 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(5/18/2009) 
N.A0.520 0.480 
Europe Samaritans
(SA000098R) 
78
(3/18/2008) 
N.A0.410 0.590 
Europe Adygei
(SA000017I) 
108
(3/18/2008) 
N.A0.537 0.463 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(5/18/2009) 
N.A0.620 0.380 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.600 0.400 
Europe Chuvash
(SA000491O) 
80
(3/18/2008) 
N.A0.613 0.388 
Europe Danes
(SA000007H) 
98
(3/18/2008) 
N.A0.561 0.439 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1952
(11/18/2009) 
N.A0.572 0.428 
Europe Europeans, Mixed
(SA000020C) 
168
(3/18/2008) 
N.A0.643 0.357 
Europe Finns
(SA000018J) 
70
(3/18/2008) 
N.A0.600 0.400 
Europe French
(SA001503J) 
58
(5/18/2009) 
N.A0.530 0.470 
Europe Hungarian
(SA002023H) 
178
(3/18/2008) 
N.A0.590 0.410 
Europe Irish
(SA000057M) 
222
(3/18/2008) 
N.A0.685 0.315 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(5/18/2009) 
N.A0.440 0.560 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(5/18/2009) 
N.A0.580 0.420 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA000490N) 
160
(3/18/2008) 
N.A0.594 0.406 
Europe Jews, Sephardic
(SA000096P) 
54
(11/21/2011) 
N.A0.480 0.520 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(5/18/2009) 
N.A0.660 0.340 
Europe Russians
(SA000019K) 
96
(3/18/2008) 
N.A0.563 0.438 
Europe Russians
(SA001530J) 
66
(3/18/2008) 
N.A0.576 0.424 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.520 0.480 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(5/18/2009) 
N.A0.590 0.410 
Europe Sardinian
(SA002768X) 
70
(11/21/2011) 
N.A0.570 0.430 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.760 0.240 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.460 0.540 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(5/18/2009) 
N.A0.670 0.330 
Asia Khanty
(SA000488U) 
98
(3/18/2008) 
N.A0.694 0.306 
Asia Komi-Zyrian
(SA000489V) 
94
(3/18/2008) 
N.A0.575 0.426 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.950 0.050 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.640 0.360 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.700 0.300 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.480 0.520 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.650 0.350 
Asia Keralite
(SA001854S) 
60
(11/21/2011) 
N.A0.600 0.400 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.620 0.380 
Asia Thoti
(SA000077O) 
28
(11/21/2011) 
N.A0.820 0.180 
EastAsia Ami
(SA000002C) 
76
(3/18/2008) 
N.A0.921 0.079 
EastAsia Atayal
(SA000021D) 
80
(3/18/2008) 
N.A0.938 0.063 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.780 0.220 
EastAsia Han
(SA000001B) 
94
(3/18/2008) 
N.A0.926 0.075 
EastAsia Han
(SA000009J) 
106
(3/18/2008) 
N.A0.793 0.208 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(5/18/2009) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Japanese
(SA000010B) 
100
(3/18/2008) 
N.A0.730 0.270 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(5/18/2009) 
N.A0.800 0.200 
Asia Kachari
(SA000040E) 
36
(11/21/2011) 
N.A0.640 0.360 
EastAsia Koreans
(SA000936S) 
108
(3/18/2008) 
N.A0.824 0.176 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/17/2009) 
N.A0.821 0.179 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.890 0.110 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(5/18/2009) 
N.A1.000 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA000022E) 
50
(3/18/2008) 
N.A0.720 0.280 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(5/18/2009) 
N.A0.680 0.320 
EastAsia Hakka
(SA000003D) 
82
(3/18/2008) 
N.A0.854 0.146 
Asia Lao Loum
(SA001853R) 
238
(3/18/2008) 
N.A0.727 0.273 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(5/18/2009) 
N.A0.910 0.090 
Oceania Papuan New Guinean
(SA000084M) 
44
(11/21/2011) 
N.A0.950 0.050 
Oceania Samoans
(SA000072J) 
18
(11/21/2011) 
N.A0.720 0.280 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA000012D) 
46
(3/18/2008) 
N.A0.957 0.044 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(5/18/2009) 
N.A0.950 0.050 
Oceania Micronesians
(SA000063J) 
68
(3/18/2008) 
N.A0.882 0.118 
Siberia Yakut
(SA000011C) 
100
(3/18/2008) 
N.A0.810 0.190 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.760 0.240 
NorthAmerica Cheyenne
(SA000023F) 
108
(3/18/2008) 
N.A0.954 0.046 
NorthAmerica Pima, Arizona
(SA000025H) 
100
(3/18/2008) 
N.A0.900 0.100 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA000026I) 
106
(3/18/2008) 
N.A0.859 0.142 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.940 0.060 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA000013E) 
92
(3/18/2008) 
N.A0.815 0.185 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.840 0.160 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(5/18/2009) 
N.A0.730 0.270 
SouthAmerica Guihiba
(SA000055K) 
26
(11/21/2011) 
N.A0.650 0.350 
SouthAmerica Karitiana
(SA000028K) 
110
(3/18/2008) 
N.A0.746 0.255 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.810 0.190 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(3/18/2008) 
N.A0.739 0.261 
SouthAmerica Surui
(SA000014F) 
88
(3/18/2008) 
N.A0.989 0.011 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(5/18/2009) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA000027J) 
122
(3/18/2008) 
N.A0.918 0.082 

Total Population Samples 110
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan