ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs16948648

Locus Name: integrin, alpha 3 (antigen CD49C, alpha 3 subunit of VLA-3 receptor)


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(5/18/2009) 
N.A0.630 0.380 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(5/18/2009) 
N.A0.630 0.380 
Africa San
(SA001469U) 
12
(5/18/2009) 
N.A0.670 0.330 
Africa Biaka
(SA000005F) 
128
(5/23/2008) 
N.A0.789 0.211 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(5/18/2009) 
N.A0.760 0.240 
Africa Hausa
(SA000100B) 
68
(5/23/2008) 
N.A0.691 0.309 
Africa Ibo
(SA000099S) 
92
(5/23/2008) 
N.A0.576 0.424 
Africa Lisongo
(SA002770Q) 
16
(11/18/2011) 
N.A0.750 0.250 
Africa Mbuti
(SA000006G) 
72
(5/23/2008) 
N.A0.944 0.056 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(5/18/2009) 
N.A0.970 0.030 
Africa Yoruba
(SA000036J) 
154
(5/23/2008) 
N.A0.539 0.461 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.600 0.400 
Africa Chagga
(SA000487T) 
88
(5/23/2008) 
N.A0.546 0.455 
Africa Jews, Ethiopian
(SA000015G) 
64
(5/23/2008) 
N.A0.391 0.609 
Africa Masai
(SA000854R) 
38
(5/23/2008) 
N.A0.605 0.395 
Africa Sandawe
(SA001773S) 
80
(5/23/2008) 
N.A0.463 0.538 
Africa Zaramo
(SA002586V) 
80
(11/18/2011) 
N.A0.480 0.520 
Africa African Americans
(SA000101C) 
164
(5/23/2008) 
N.A0.579 0.421 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.540 0.460 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(5/18/2009) 
N.A0.250 0.750 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(5/18/2009) 
N.A0.250 0.750 
Asia Druze
(SA000047L) 
200
(5/23/2008) 
N.A0.215 0.785 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(5/18/2009) 
N.A0.300 0.700 
Asia Jews, Yemenite
(SA000016H) 
86
(5/23/2008) 
N.A0.233 0.767 
Asia Kuwaiti
(SA002765U) 
32
(11/18/2011) 
N.A0.380 0.620 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(5/18/2009) 
N.A0.240 0.760 
Europe Samaritans
(SA000098R) 
78
(5/23/2008) 
N.A0.013 0.987 
Europe Adygei
(SA000017I) 
108
(5/23/2008) 
N.A0.315 0.685 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(5/18/2009) 
N.A0.260 0.740 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.250 0.750 
Europe Chuvash
(SA000491O) 
80
(5/23/2008) 
N.A0.375 0.625 
Europe Danes
(SA000007H) 
98
(5/23/2008) 
N.A0.194 0.806 
Europe Europeans, Mixed
(SA000020C) 
162
(5/23/2008) 
N.A0.198 0.803 
Europe Finns
(SA000018J) 
70
(5/23/2008) 
N.A0.229 0.771 
Europe French
(SA001503J) 
58
(5/18/2009) 
N.A0.100 0.900 
Europe Hungarian
(SA002023H) 
178
(5/23/2008) 
N.A0.236 0.764 
Europe Irish
(SA000057M) 
224
(5/23/2008) 
N.A0.152 0.848 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(5/18/2009) 
N.A0.250 0.750 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(5/18/2009) 
N.A0.350 0.650 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA000490N) 
156
(5/23/2008) 
N.A0.147 0.853 
Europe Jews, Sephardic
(SA000096P) 
54
(11/18/2011) 
N.A0.280 0.720 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(5/18/2009) 
N.A0.060 0.940 
Europe Russians
(SA000019K) 
96
(5/23/2008) 
N.A0.208 0.792 
Europe Russians
(SA001530J) 
66
(5/23/2008) 
N.A0.379 0.621 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.240 0.760 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(5/18/2009) 
N.A0.270 0.730 
Europe Sardinian
(SA002768X) 
70
(11/18/2011) 
N.A0.260 0.740 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.560 0.440 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.220 0.780 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(5/18/2009) 
N.A0.500 0.500 
Asia Khanty
(SA000488U) 
98
(5/23/2008) 
N.A0.663 0.337 
Asia Komi-Zyrian
(SA000489V) 
94
(5/23/2008) 
N.A0.330 0.670 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.420 0.580 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.400 0.600 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.560 0.440 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.420 0.580 
Asia Keralite
(SA001854S) 
60
(11/18/2011) 
N.A0.570 0.430 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.500 0.500 
Asia Thoti
(SA000077O) 
28
(11/18/2011) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Ami
(SA000002C) 
76
(5/23/2008) 
N.A0.947 0.053 
EastAsia Atayal
(SA000021D) 
80
(5/23/2008) 
N.A0.825 0.175 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Han
(SA000001B) 
94
(5/23/2008) 
N.A0.787 0.213 
EastAsia Han
(SA000009J) 
106
(5/23/2008) 
N.A0.774 0.226 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(5/18/2009) 
N.A0.760 0.240 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Japanese
(SA000010B) 
100
(5/23/2008) 
N.A0.710 0.290 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(5/18/2009) 
N.A0.730 0.270 
Asia Kachari
(SA000040E) 
36
(11/18/2011) 
N.A0.530 0.470 
EastAsia Koreans
(SA000936S) 
108
(5/23/2008) 
N.A0.759 0.241 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/17/2009) 
N.A0.759 0.241 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.780 0.220 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(5/18/2009) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(5/18/2009) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA000022E) 
48
(5/23/2008) 
N.A0.688 0.313 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(5/18/2009) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Hakka
(SA000003D) 
82
(5/23/2008) 
N.A0.842 0.159 
Asia Lao Loum
(SA001853R) 
238
(5/23/2008) 
N.A0.786 0.214 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(5/18/2009) 
N.A0.970 0.030 
Oceania Papuan New Guinean
(SA000084M) 
44
(11/18/2011) 
N.A0.950 0.050 
Oceania Samoans
(SA000072J) 
18
(11/18/2011) 
N.A0.890 0.110 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA000012D) 
46
(5/23/2008) 
N.A0.717 0.283 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(5/18/2009) 
N.A0.680 0.320 
Oceania Micronesians
(SA000063J) 
68
(5/23/2008) 
N.A0.971 0.029 
Siberia Yakut
(SA000011C) 
100
(5/23/2008) 
N.A0.620 0.380 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.600 0.400 
NorthAmerica Cheyenne
(SA000023F) 
108
(5/23/2008) 
N.A0.639 0.361 
NorthAmerica Pima, Arizona
(SA000025H) 
100
(5/23/2008) 
N.A0.670 0.330 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA000026I) 
102
(5/23/2008) 
N.A0.559 0.441 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.520 0.480 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA000013E) 
92
(5/23/2008) 
N.A0.641 0.359 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(5/18/2009) 
N.A0.660 0.340 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(5/18/2009) 
N.A0.690 0.310 
SouthAmerica Guihiba
(SA000055K) 
26
(11/18/2011) 
N.A0.920 0.080 
SouthAmerica Karitiana
(SA000028K) 
110
(5/23/2008) 
N.A0.964 0.036 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(5/18/2009) 
N.A0.980 0.020 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(5/23/2008) 
N.A0.522 0.478 
SouthAmerica Surui
(SA000014F) 
88
(5/23/2008) 
N.A0.421 0.580 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(5/18/2009) 
N.A0.360 0.640 
SouthAmerica Ticuna
(SA000027J) 
122
(5/23/2008) 
N.A0.533 0.467 

Total Population Samples 109
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan