ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs1227759

Locus Name: collagen, type XIII, alpha 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(7/23/2010) 
N.A0.880 0.130 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(7/23/2010) 
N.A0.960 0.040 
Africa San
(SA001469U) 
12
(7/23/2010) 
N.A0.580 0.420 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(7/23/2010) 
N.A0.870 0.130 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(7/23/2010) 
N.A0.230 0.770 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.880 0.130 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(7/23/2010) 
N.A0.970 0.030 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(7/23/2010) 
N.A0.790 0.210 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(7/23/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(7/23/2010) 
N.A0.880 0.120 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.620 0.380 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.900 0.100 
Europe French
(SA001503J) 
58
(7/23/2010) 
N.A0.880 0.120 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(7/23/2010) 
N.A0.880 0.130 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.920 0.080 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(7/23/2010) 
N.A0.840 0.160 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.860 0.140 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.960 0.040 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.840 0.160 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(7/23/2010) 
N.A0.890 0.110 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.920 0.080 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.980 0.020 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.810 0.190 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(7/23/2010) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.720 0.280 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.840 0.160 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.852 0.148 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(7/23/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.830 0.170 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(7/23/2010) 
N.A0.820 0.180 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.910 0.090 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(7/23/2010) 
N.A0.760 0.240 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.880 0.120 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(7/23/2010) 
N.A1.000 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.960 0.040 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.960 0.040 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.980 0.020 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(7/23/2010) 
N.A1.000 

Total Population Samples 53
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan