ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs1609478

Locus Name: ATPase, Ca++ transporting, type 2C, member 2


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa San
(SA001469U) 
12
(8/6/2010) 
N.A0.170 0.830 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(8/6/2010) 
N.A0.110 0.890 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(8/6/2010) 
N.A0.070 0.930 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.060 0.940 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.040 0.960 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(8/6/2010) 
N.A0.280 0.720 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(8/6/2010) 
N.A0.160 0.840 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(8/6/2010) 
N.A0.160 0.840 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(8/6/2010) 
N.A0.180 0.820 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(8/6/2010) 
N.A0.320 0.680 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.350 0.650 
Europe French
(SA001503J) 
58
(8/6/2010) 
N.A0.220 0.780 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(8/6/2010) 
N.A0.250 0.750 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(8/6/2010) 
N.A0.380 0.620 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(8/6/2010) 
N.A0.160 0.840 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.400 0.600 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(8/6/2010) 
N.A0.410 0.590 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.260 0.740 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.180 0.820 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(8/6/2010) 
N.A0.200 0.800 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.350 0.650 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.140 0.860 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.240 0.760 
Asia Brahui
(SA001475R) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.190 0.810 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.190 0.810 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.220 0.780 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.390 0.610 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(8/6/2010) 
N.A0.270 0.730 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.280 0.720 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(8/6/2010) 
N.A0.320 0.680 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.315 0.685 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.220 0.780 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.280 0.720 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(8/6/2010) 
N.A0.140 0.860 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(8/6/2010) 
N.A0.060 0.940 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(8/6/2010) 
N.A0.110 0.890 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.200 0.800 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.220 0.780 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.120 0.880 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(8/6/2010) 
N.A0.190 0.810 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.460 0.540 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(8/6/2010) 
N.A0.240 0.760 

Total Population Samples 53
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan