ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs17143021

Locus Name: Glucocorticoid induced transcript 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(8/27/2010) 
N.A0.880 0.130 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(8/27/2010) 
N.A0.830 0.170 
Africa San
(SA001469U) 
12
(8/27/2010) 
N.A0.420 0.580 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(8/27/2010) 
N.A0.840 0.160 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(8/27/2010) 
N.A0.930 0.070 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.880 0.130 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.770 0.230 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(8/27/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(8/27/2010) 
N.A0.830 0.170 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(8/27/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(8/27/2010) 
N.A0.840 0.160 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(8/27/2010) 
N.A0.910 0.090 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.880 0.130 
Europe French
(SA001503J) 
58
(8/27/2010) 
N.A0.860 0.140 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(8/27/2010) 
N.A0.810 0.190 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(8/27/2010) 
N.A0.910 0.090 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.900 0.100 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.910 0.090 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.800 0.200 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(8/27/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.750 0.250 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.860 0.140 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.830 0.170 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.820 0.180 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.780 0.220 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(8/27/2010) 
N.A0.680 0.320 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.759 0.241 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.890 0.110 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(8/27/2010) 
N.A0.730 0.270 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(8/27/2010) 
N.A0.970 0.030 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(8/27/2010) 
N.A0.820 0.180 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.980 0.020 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.320 0.680 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.760 0.240 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(8/27/2010) 
N.A0.880 0.120 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.960 0.040 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(8/27/2010) 
N.A0.810 0.190 

Total Population Samples 53
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan