ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs2274179

Locus Name: collagen, type XIII, alpha 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
GT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(9/10/2010) 
N.A1.000 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(9/10/2010) 
N.A0.880 0.130 
Africa San
(SA001469U) 
12
(9/10/2010) 
N.A0.830 0.170 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(9/10/2010) 
N.A0.950 0.050 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(9/10/2010) 
N.A0.900 0.100 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.900 0.100 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(9/10/2010) 
N.A0.930 0.070 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(9/10/2010) 
N.A0.890 0.110 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(9/10/2010) 
N.A0.760 0.240 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(9/10/2010) 
N.A0.840 0.160 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(9/10/2010) 
N.A0.790 0.210 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.850 0.150 
Europe French
(SA001503J) 
58
(9/10/2010) 
N.A0.780 0.220 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(9/10/2010) 
N.A0.630 0.380 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(9/10/2010) 
N.A0.810 0.190 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(9/10/2010) 
N.A0.720 0.280 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.840 0.160 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(9/10/2010) 
N.A0.790 0.210 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.580 0.420 
Asia Kalash
(SA001481O) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.670 0.330 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(9/10/2010) 
N.A0.800 0.200 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.860 0.140 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.710 0.290 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.740 0.260 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(9/10/2010) 
N.A0.640 0.360 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(9/10/2010) 
N.A0.640 0.360 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.481 0.519 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.720 0.280 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(9/10/2010) 
N.A0.860 0.140 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
30
(9/10/2010) 
N.A0.900 0.100 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(9/10/2010) 
N.A0.630 0.370 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.560 0.440 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.240 0.760 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.580 0.420 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(9/10/2010) 
N.A0.810 0.190 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.190 0.810 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(9/10/2010) 
N.A0.570 0.430 

Total Population Samples 53
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan