ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs2395280

Locus Name: collagen, type XIII, alpha 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(9/10/2010) 
N.A0.630 0.380 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(9/10/2010) 
N.A0.580 0.420 
Africa San
(SA001469U) 
12
(9/10/2010) 
N.A0.830 0.170 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(9/10/2010) 
N.A0.740 0.260 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(9/10/2010) 
N.A0.670 0.330 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.440 0.560 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.520 0.480 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(9/10/2010) 
N.A0.550 0.450 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(9/10/2010) 
N.A0.630 0.380 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(9/10/2010) 
N.A0.730 0.270 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(9/10/2010) 
N.A0.650 0.350 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.690 0.310 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1950
(11/18/2009) 
N.A0.654 0.346 
Europe French
(SA001503J) 
58
(9/10/2010) 
N.A0.690 0.310 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(9/10/2010) 
N.A0.630 0.380 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(9/10/2010) 
N.A0.730 0.270 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(9/10/2010) 
N.A0.560 0.440 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.680 0.320 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(9/10/2010) 
N.A0.660 0.340 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.880 0.120 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.960 0.040 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(9/10/2010) 
N.A0.760 0.240 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(9/10/2010) 
N.A1.000 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.680 0.320 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.830 0.170 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.660 0.340 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(9/10/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(9/10/2010) 
N.A0.980 0.020 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(9/10/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.972 0.028 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(9/10/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(9/10/2010) 
N.A1.000 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(9/10/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(9/10/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(9/10/2010) 
N.A0.950 0.050 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(9/10/2010) 
N.A0.850 0.150 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(9/10/2010) 
N.A0.840 0.160 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.940 0.060 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.900 0.100 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.920 0.080 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(9/10/2010) 
N.A0.920 0.080 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.770 0.230 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(9/10/2010) 
N.A0.740 0.260 

Total Population Samples 54
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan