ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the U. S. National Science Foundation.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs310362

Locus Name: thymocyte selection-associated high mobility group box


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(9/17/2010) 
N.A0.880 0.130 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(9/17/2010) 
N.A1.000 
Africa San
(SA001469U) 
12
(9/17/2010) 
N.A1.000 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(9/17/2010) 
N.A1.000 
Africa Biaka
(SA000005F) 
138
(11/21/2011) 
N.A0.980 0.020 
Africa Hausa
(SA000100B) 
76
(11/21/2011) 
N.A0.800 0.200 
Africa Ibo
(SA000099S) 
96
(11/21/2011) 
N.A0.940 0.060 
Africa Lisongo
(SA002770Q) 
16
(11/21/2011) 
N.A0.750 0.250 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(9/17/2010) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA000006G) 
78
(11/21/2011) 
N.A0.970 0.030 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.960 0.040 
Africa Yoruba
(SA000036J) 
154
(11/21/2011) 
N.A0.920 0.080 
Africa Chagga
(SA000487T) 
90
(11/21/2011) 
N.A0.830 0.170 
Africa Jews, Ethiopian
(SA000015G) 
82
(11/21/2011) 
N.A0.770 0.230 
Africa Masai
(SA000854R) 
40
(11/21/2011) 
N.A0.780 0.220 
Africa Sandawe
(SA001773S) 
80
(11/21/2011) 
N.A0.840 0.160 
Africa Zaramo
(SA002586V) 
80
(11/21/2011) 
N.A0.860 0.140 
Africa African Americans
(SA000101C) 
180
(11/21/2011) 
N.A0.810 0.190 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.940 0.060 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(9/17/2010) 
N.A0.770 0.230 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(9/17/2010) 
N.A0.600 0.400 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(9/17/2010) 
N.A0.670 0.330 
Asia Druze
(SA000047L) 
250
(11/21/2011) 
N.A0.610 0.390 
Asia Jews, Yemenite
(SA000016H) 
84
(11/21/2011) 
N.A0.710 0.290 
Asia Kuwaiti
(SA002765U) 
32
(11/21/2011) 
N.A0.620 0.380 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(9/17/2010) 
N.A0.740 0.260 
Europe Samaritans
(SA000098R) 
78
(11/21/2011) 
N.A0.860 0.140 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(9/17/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Adygei
(SA000017I) 
108
(11/21/2011) 
N.A0.540 0.460 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.330 0.670 
Europe Chuvash
(SA000491O) 
82
(11/21/2011) 
N.A0.460 0.540 
Europe Danes
(SA000007H) 
102
(11/21/2011) 
N.A0.360 0.640 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1952
(11/18/2009) 
N.A0.375 0.625 
Europe Europeans, Mixed
(SA000020C) 
182
(11/21/2011) 
N.A0.420 0.580 
Europe Finns
(SA000018J) 
68
(11/21/2011) 
N.A0.210 0.790 
Europe French
(SA001503J) 
58
(9/17/2010) 
N.A0.330 0.670 
Europe Hungarian
(SA002023H) 
178
(5/17/2013) 
N.A0.433 0.567 
Europe Irish
(SA000057M) 
224
(11/21/2011) 
N.A0.320 0.680 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(9/17/2010) 
N.A0.560 0.440 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(9/17/2010) 
N.A0.350 0.650 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA000490N) 
274
(11/21/2011) 
N.A0.610 0.390 
Europe Jews, Sephardic
(SA000096P) 
54
(11/21/2011) 
N.A0.740 0.260 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(9/17/2010) 
N.A0.220 0.780 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.320 0.680 
Europe Russians
(SA000019K) 
96
(11/21/2011) 
N.A0.360 0.640 
Europe Russians
(SA001530J) 
66
(11/21/2011) 
N.A0.410 0.590 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(9/17/2010) 
N.A0.270 0.730 
Europe Sardinian
(SA002768X) 
70
(11/21/2011) 
N.A0.400 0.600 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.260 0.740 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(9/17/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Khanty
(SA000488U) 
100
(11/21/2011) 
N.A0.230 0.770 
Asia Komi-Zyrian
(SA000489V) 
92
(11/21/2011) 
N.A0.360 0.640 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.450 0.550 
Asia Mongolian
(SA004035M) 
130
(2/22/2012) 
N.A0.385 0.615 
Asia Tsaatan
(SA004036N) 
92
(2/22/2012) 
N.A0.522 0.478 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.580 0.420 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Keralite
(SA001854S) 
60
(11/21/2011) 
N.A0.430 0.570 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Thoti
(SA000077O) 
28
(11/21/2011) 
N.A0.680 0.320 
EastAsia Ami
(SA000002C) 
78
(11/21/2011) 
N.A0.640 0.360 
EastAsia Atayal
(SA000021D) 
84
(11/21/2011) 
N.A0.540 0.460 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.170 0.830 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(9/17/2010) 
N.A0.470 0.530 
EastAsia Han
(SA000001B) 
100
(11/21/2011) 
N.A0.470 0.530 
EastAsia Han
(SA000009J) 
116
(11/21/2011) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(9/17/2010) 
N.A0.410 0.590 
EastAsia Japanese
(SA000010B) 
98
(11/21/2011) 
N.A0.370 0.630 
Asia Kachari
(SA000040E) 
34
(11/21/2011) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.444 0.556 
EastAsia Koreans
(SA000936S) 
108
(11/21/2011) 
N.A0.440 0.560 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.220 0.780 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.390 0.610 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(9/17/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA000022E) 
48
(11/21/2011) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Hakka
(SA000003D) 
80
(11/21/2011) 
N.A0.490 0.510 
Asia Lao Loum
(SA001853R) 
238
(11/21/2011) 
N.A0.520 0.480 
EastAsia Malaysians
(SA000097Q) 
22
(11/21/2011) 
N.A0.180 0.820 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(9/17/2010) 
N.A0.240 0.760 
Oceania Papuan New Guinean
(SA000084M) 
44
(11/21/2011) 
N.A0.140 0.860 
Oceania Samoans
(SA000072J) 
18
(11/21/2011) 
N.A0.500 0.500 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(9/17/2010) 
N.A0.210 0.790 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA000012D) 
46
(11/21/2011) 
N.A0.220 0.780 
Oceania Micronesians
(SA000063J) 
70
(11/21/2011) 
N.A0.790 0.210 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.420 0.580 
Siberia Yakut
(SA000011C) 
100
(11/21/2011) 
N.A0.380 0.620 
NorthAmerica Cheyenne
(SA000023F) 
112
(11/21/2011) 
N.A0.250 0.750 
NorthAmerica Mvskoke
(SA000064K) 
20
(11/21/2011) 
N.A0.400 0.600 
NorthAmerica Pima, Arizona
(SA000025H) 
102
(11/21/2011) 
N.A0.500 0.500 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.260 0.740 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA000026I) 
198
(11/21/2011) 
N.A0.180 0.820 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.340 0.660 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA000013E) 
98
(11/21/2011) 
N.A0.460 0.540 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(9/17/2010) 
N.A0.230 0.770 
SouthAmerica Guihiba
(SA000055K) 
24
(11/21/2011) 
N.A0.170 0.830 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.170 0.830 
SouthAmerica Karitiana
(SA000028K) 
106
(11/21/2011) 
N.A0.130 0.870 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(11/21/2011) 
N.A0.460 0.540 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(9/17/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA000014F) 
90
(11/21/2011) 
N.A0.060 0.940 
SouthAmerica Ticuna
(SA000027J) 
130
(11/21/2011) 
N.A0.570 0.430 

Total Population Samples 114
Total Alleles: 2


© 2012 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan