ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs10864308

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.060 0.940 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(6/5/2010) 
N.A0.380 0.630 
Africa San
(SA001469U) 
12
(6/5/2010) 
N.A1.000 
Africa Afro-Caribbeans
(SA004242M) 
192
(9/5/2018) 
N.A0.224 0.776 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(6/5/2010) 
N.A0.080 0.920 
Africa Esan
(SA004248S) 
198
(9/5/2018) 
N.A0.192 0.808 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.214 0.786 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.208 0.792 
Africa Malinke
(SA004243N) 
226
(9/5/2018) 
N.A0.155 0.845 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(6/5/2010) 
N.A0.070 0.930 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.079 0.921 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.420 0.580 
Africa Yoruba
(SA004048Q) 
216
(9/5/2018) 
N.A0.218 0.782 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.333 0.667 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.484 0.516 
Africa Luhya
(SA004046O) 
198
(9/5/2018) 
N.A0.136 0.864 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.353 0.647 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.121 0.879 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.218 0.782 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.317 0.683 
Africa African Americans
(SA004047P) 
122
(9/5/2018) 
N.A0.254 0.746 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.100 0.900 
Africa Mende
(SA004244O) 
170
(9/5/2018) 
N.A0.100 0.900 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(6/5/2010) 
N.A0.650 0.350 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(6/5/2010) 
N.A0.720 0.280 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(6/5/2010) 
N.A0.720 0.280 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.878 0.122 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(6/5/2010) 
N.A0.710 0.290 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.790 0.211 
Europe Abkhaz
(SA004584V) 
52
(9/5/2018) 
N.A0.692 0.308 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.500 0.500 
Europe Adygei
(SA004585W) 
62
(9/5/2018) 
N.A0.565 0.435 
Europe Bashkir
(SA004615Q) 
68
(9/5/2018) 
N.A0.471 0.529 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.690 0.310 
Europe Belarusian
(SA004586X) 
56
(9/5/2018) 
N.A0.732 0.268 
Europe British
(SA004050J) 
182
(9/5/2018) 
N.A0.802 0.198 
Europe Chechen
(SA004589A) 
36
(9/5/2018) 
N.A0.694 0.306 
Europe Cherkess
(SA004588Z) 
66
(9/5/2018) 
N.A0.500 0.500 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.634 0.366 
Europe Chuvash
(SA004600K) 
56
(9/5/2018) 
N.A0.607 0.393 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.779 0.221 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1952
(11/18/2009) 
N.A0.762 0.238 
Europe European Americans
(SA004250L) 
198
(9/5/2018) 
N.A0.742 0.258 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.720 0.280 
Europe Finns
(SA004049R) 
198
(9/5/2018) 
N.A0.606 0.394 
Europe French
(SA001503J) 
58
(6/5/2010) 
N.A0.710 0.290 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.732 0.268 
Europe Iberian
(SA004108N) 
214
(9/5/2018) 
N.A0.682 0.318 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.659 0.341 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(6/5/2010) 
N.A1.000 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(6/5/2010) 
N.A0.810 0.190 
Europe Italians
(SA004057Q) 
214
(9/5/2018) 
N.A0.640 0.360 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.813 0.188 
Europe Kabardinian
(SA004590S) 
70
(9/5/2018) 
N.A0.500 0.500 
Europe Karachay
(SA004591T) 
46
(9/5/2018) 
N.A0.522 0.478 
Europe Karelians
(SA004617S) 
52
(9/5/2018) 
N.A0.615 0.385 
Europe Megrelians
(SA004623P) 
72
(9/5/2018) 
N.A0.681 0.319 
Europe Moldovan
(SA004598A) 
64
(9/5/2018) 
N.A0.547 0.453 
Europe Mordvin
(SA004599B) 
66
(9/5/2018) 
N.A0.727 0.273 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(6/5/2010) 
N.A0.660 0.340 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.680 0.320 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.691 0.310 
Europe Russians
(SA004601L) 
76
(9/5/2018) 
N.A0.697 0.303 
Europe Russians
(SA004603N) 
78
(9/5/2018) 
N.A0.692 0.308 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.750 0.250 
Europe Tatar
(SA004604O) 
68
(9/5/2018) 
N.A0.735 0.265 
Europe Udmurt
(SA004607R) 
50
(9/5/2018) 
N.A0.520 0.480 
Europe Ukrainian
(SA004608S) 
58
(9/5/2018) 
N.A0.672 0.328 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.460 0.540 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.660 0.340 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(6/5/2010) 
N.A0.630 0.370 
Asia Kazakh
(SA004593V) 
90
(9/5/2018) 
N.A0.489 0.511 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.585 0.415 
Asia Khanty
(SA004595X) 
58
(9/5/2018) 
N.A0.552 0.448 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.620 0.380 
Asia Komi-Zyrian
(SA004596Y) 
64
(9/5/2018) 
N.A0.641 0.359 
Asia Kyrgyz
(SA004597Z) 
56
(9/5/2018) 
N.A0.607 0.393 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.450 0.550 
Asia Uzbek
(SA004609T) 
78
(9/5/2018) 
N.A0.641 0.359 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.740 0.260 
Asia Bengali
(SA004239S) 
172
(9/5/2018) 
N.A0.558 0.442 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.680 0.320 
Asia Gujarati
(SA004246Q) 
206
(9/5/2018) 
N.A0.660 0.340 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.650 0.350 
Asia Punjabi
(SA004240K) 
192
(9/5/2018) 
N.A0.542 0.458 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Tamil
(SA004241L) 
204
(9/5/2018) 
N.A0.539 0.461 
Asia Telugu
(SA004247R) 
204
(9/5/2018) 
N.A0.578 0.422 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.474 0.526 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.515 0.485 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Dai
(SA004238R) 
196
(9/5/2018) 
N.A0.473 0.527 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.440 0.560 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(6/5/2010) 
N.A0.490 0.510 
EastAsia Han
(SA004058R) 
206
(9/5/2018) 
N.A0.393 0.607 
EastAsia Han
(SA004059S) 
210
(9/5/2018) 
N.A0.352 0.648 
EastAsia Han
(SA004592U) 
26
(9/5/2018) 
N.A0.154 0.846 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.280 0.720 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.540 0.460 
EastAsia Japanese
(SA004060K) 
208
(9/5/2018) 
N.A0.457 0.543 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/4/2009) 
N.A0.324 0.676 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.390 0.610 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.220 0.780 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(6/5/2010) 
N.A0.320 0.680 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.267 0.733 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.554 0.446 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.466 0.534 
EastAsia Vietnamese
(SA004249T) 
202
(9/5/2018) 
N.A0.490 0.510 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.410 0.590 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(6/5/2010) 
N.A0.610 0.390 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.439 0.561 
Siberia Buryat
(SA004587Y) 
88
(9/5/2018) 
N.A0.455 0.545 
Asia Ket
(SA004594W) 
62
(9/5/2018) 
N.A0.403 0.597 
Siberia Tuva
(SA004605P) 
88
(9/5/2018) 
N.A0.409 0.591 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.420 0.580 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.429 0.571 
Siberia Yakut
(SA004610L) 
82
(9/5/2018) 
N.A0.463 0.537 
NorthAmerica Mexicans
(SA004110G) 
128
(9/5/2018) 
N.A0.391 0.609 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.360 0.640 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.260 0.740 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.405 0.595 
NorthAmerica Puerto Rican
(SA004111H) 
208
(9/5/2018) 
N.A0.601 0.399 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(6/5/2010) 
N.A0.040 0.960 
SouthAmerica Colombian
(SA004109O) 
188
(9/5/2018) 
N.A0.564 0.436 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.380 0.630 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.220 0.780 
SouthAmerica Peruvian
(SA004245P) 
170
(9/5/2018) 
N.A0.259 0.741 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.261 0.739 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(6/5/2010) 
N.A0.600 0.400 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.435 0.565 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.103 0.897 

Total Population Samples 141
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan