ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs10864732

Locus Name: UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (GalNAc-T2)


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.060 0.940 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(6/5/2010) 
N.A0.250 0.750 
Africa San
(SA001469U) 
12
(6/5/2010) 
N.A0.080 0.920 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(6/5/2010) 
N.A0.260 0.740 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(6/10/2016) 
N.A0.161 0.839 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(6/10/2016) 
N.A0.028 0.972 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(6/5/2010) 
N.A0.070 0.930 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(6/10/2016) 
N.A0.184 0.816 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.020 0.980 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(6/10/2016) 
N.A0.115 0.885 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(6/10/2016) 
N.A0.117 0.883 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(6/10/2016) 
N.A0.029 0.971 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(6/10/2016) 
N.A0.121 0.879 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(6/10/2016) 
N.A0.180 0.821 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(6/10/2016) 
N.A0.200 0.800 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.080 0.920 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(6/5/2010) 
N.A0.580 0.420 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(6/5/2010) 
N.A0.420 0.580 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(6/5/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(6/10/2016) 
N.A0.608 0.392 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(6/5/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(6/10/2016) 
N.A0.303 0.697 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.850 0.150 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(6/10/2016) 
N.A0.619 0.381 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.580 0.420 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(6/10/2016) 
N.A0.524 0.476 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(6/10/2016) 
N.A0.500 0.500 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1938
(11/18/2009) 
N.A0.578 0.422 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(6/10/2016) 
N.A0.540 0.460 
Europe French
(SA001503J) 
58
(6/5/2010) 
N.A0.520 0.480 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(6/10/2016) 
N.A0.695 0.305 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(6/10/2016) 
N.A0.614 0.386 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.630 0.380 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(6/5/2010) 
N.A0.580 0.420 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(6/10/2016) 
N.A0.583 0.417 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(6/5/2010) 
N.A0.440 0.560 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.520 0.480 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(6/10/2016) 
N.A0.476 0.524 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.640 0.360 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(6/5/2010) 
N.A0.570 0.430 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(6/10/2016) 
N.A0.330 0.670 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(6/10/2016) 
N.A0.435 0.565 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.100 0.900 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.840 0.160 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.600 0.400 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.640 0.360 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.420 0.580 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.360 0.640 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(6/10/2016) 
N.A0.197 0.803 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(6/10/2016) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(6/5/2010) 
N.A0.090 0.910 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.060 0.940 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.020 0.980 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/4/2009) 
N.A0.083 0.917 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.060 0.940 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(6/10/2016) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(6/10/2016) 
N.A0.068 0.932 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(6/10/2016) 
N.A0.195 0.805 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.210 0.790 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(6/10/2016) 
N.A0.227 0.773 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.180 0.820 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(6/10/2016) 
N.A0.143 0.857 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.280 0.720 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.220 0.780 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(6/10/2016) 
N.A0.024 0.976 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(6/5/2010) 
N.A0.120 0.880 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.060 0.940 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(6/10/2016) 
N.A0.100 0.900 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(6/10/2016) 
N.A0.087 0.913 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(6/5/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(6/10/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(6/10/2016) 
N.A0.265 0.735 

Total Population Samples 87
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan