ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs1093040

Locus Name: Family with sequence similarity 5, member C


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.810 0.190 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(6/5/2010) 
N.A0.710 0.290 
Africa San
(SA001469U) 
12
(6/5/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(6/5/2010) 
N.A0.890 0.110 
Africa Hausa
(SA003960S) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.720 0.280 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(6/6/2016) 
N.A0.750 0.250 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(6/6/2016) 
N.A0.722 0.278 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(6/5/2010) 
N.A0.970 0.030 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(6/6/2016) 
N.A0.895 0.105 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.790 0.210 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(6/6/2016) 
N.A0.808 0.192 
Africa Jews, Ethiopian
(SA003973W) 
48
(2/27/2012) 
N.A1.000 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(6/6/2016) 
N.A0.936 0.065 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(6/6/2016) 
N.A0.677 0.324 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(6/6/2016) 
N.A0.894 0.106 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(6/6/2016) 
N.A0.731 0.269 
Africa African Americans
(SA003982W) 
116
(2/27/2012) 
N.A0.760 0.240 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(6/6/2016) 
N.A0.833 0.167 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.690 0.310 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(6/5/2010) 
N.A0.950 0.050 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(6/5/2010) 
N.A0.930 0.070 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(6/5/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Druze
(SA003961T) 
54
(2/27/2012) 
N.A0.850 0.150 
Asia Jews, Yemenite
(SA003959A) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.980 0.020 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(6/6/2016) 
N.A0.987 0.014 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(6/5/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(6/6/2016) 
N.A0.842 0.158 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.970 0.030 
Europe Adygei
(SA003974X) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.960 0.040 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(6/6/2016) 
N.A0.881 0.119 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.900 0.100 
Europe Chuvash
(SA003969B) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.780 0.220 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(6/6/2016) 
N.A0.781 0.220 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(6/6/2016) 
N.A0.814 0.186 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1950
(11/18/2009) 
N.A0.792 0.208 
Europe European Americans
(SA003983X) 
74
(2/27/2012) 
N.A0.810 0.190 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(6/6/2016) 
N.A0.720 0.280 
Europe French
(SA001503J) 
58
(6/5/2010) 
N.A0.740 0.260 
Europe Hungarian
(SA003976Z) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.840 0.160 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(6/6/2016) 
N.A0.842 0.159 
Europe Irish
(SA003979C) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.870 0.130 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(6/6/2016) 
N.A0.909 0.091 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.880 0.130 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(6/5/2010) 
N.A0.850 0.150 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(6/6/2016) 
N.A0.833 0.167 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(6/5/2010) 
N.A0.840 0.160 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.780 0.220 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(6/6/2016) 
N.A0.762 0.238 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.920 0.080 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(6/5/2010) 
N.A0.870 0.130 
Asia Khanty
(SA003968A) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.630 0.370 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(6/6/2016) 
N.A0.596 0.404 
Asia Komi-Zyrian
(SA003962U) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.750 0.250 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(6/6/2016) 
N.A0.772 0.228 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.750 0.250 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.880 0.120 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.880 0.120 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.960 0.040 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.790 0.210 
Asia Keralite
(SA003963V) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.900 0.100 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.920 0.080 
EastAsia Ami
(SA003975Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(6/6/2016) 
N.A0.649 0.351 
EastAsia Atayal
(SA003971U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.820 0.180 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(6/6/2016) 
N.A0.824 0.177 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(6/5/2010) 
N.A0.810 0.190 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.820 0.180 
EastAsia Japanese
(SA003972V) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.810 0.190 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/4/2009) 
N.A0.778 0.222 
EastAsia Koreans
(SA003958Z) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.710 0.290 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.610 0.390 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.720 0.280 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(6/5/2010) 
N.A0.820 0.180 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA003967Z) 
36
(2/27/2012) 
N.A0.690 0.310 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(6/6/2016) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Hakka
(SA003978B) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.790 0.210 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(6/6/2016) 
N.A0.824 0.176 
Asia Lao Loum
(SA003980U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.720 0.280 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(6/6/2016) 
N.A0.678 0.322 
Oceania Gimi
(SA003981V) 
30
(2/27/2012) 
N.A0.900 0.100 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.850 0.150 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(6/5/2010) 
N.A0.950 0.050 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA003966Y) 
34
(2/27/2012) 
N.A0.970 0.030 
Oceania Micronesians
(SA003977A) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.710 0.290 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(6/6/2016) 
N.A0.636 0.364 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.540 0.460 
Siberia Yakut
(SA003970T) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.560 0.440 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(6/6/2016) 
N.A0.619 0.381 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.980 0.020 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA003955W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.980 0.020 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.980 0.020 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA003964W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.940 0.060 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(6/6/2016) 
N.A0.929 0.071 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(6/5/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(6/5/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA003957Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(6/6/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA003965X) 
46
(2/27/2012) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(6/6/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(6/5/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(6/6/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA003956X) 
50
(2/27/2012) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(6/6/2016) 
N.A1.000 

Total Population Samples 116
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan