ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs1153952

Locus Name: calpain 2, (m/II) large subunit


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(7/23/2010) 
N.A0.810 0.190 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(7/23/2010) 
N.A0.710 0.290 
Africa San
(SA001469U) 
12
(7/23/2010) 
N.A0.670 0.330 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(7/23/2010) 
N.A0.690 0.310 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(6/9/2016) 
N.A0.643 0.357 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(6/9/2016) 
N.A0.736 0.264 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(7/23/2010) 
N.A0.730 0.270 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(6/9/2016) 
N.A0.763 0.237 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.770 0.230 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(6/9/2016) 
N.A0.654 0.346 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(6/9/2016) 
N.A0.452 0.548 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(6/9/2016) 
N.A0.529 0.471 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(6/9/2016) 
N.A0.394 0.606 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(6/9/2016) 
N.A0.628 0.372 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(6/9/2016) 
N.A0.617 0.383 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.810 0.190 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(7/23/2010) 
N.A0.350 0.650 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(7/23/2010) 
N.A0.280 0.720 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(7/23/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(6/9/2016) 
N.A0.297 0.703 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(7/23/2010) 
N.A0.250 0.750 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(6/9/2016) 
N.A0.171 0.829 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.060 0.940 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(6/9/2016) 
N.A0.262 0.738 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.190 0.810 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(6/9/2016) 
N.A0.195 0.805 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(6/9/2016) 
N.A0.140 0.861 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(6/9/2016) 
N.A0.040 0.960 
Europe French
(SA001503J) 
58
(7/23/2010) 
N.A0.120 0.880 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(6/9/2016) 
N.A0.171 0.829 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(6/9/2016) 
N.A0.068 0.932 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(7/23/2010) 
N.A0.190 0.810 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.080 0.920 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(6/9/2016) 
N.A0.208 0.792 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(7/23/2010) 
N.A0.220 0.780 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.120 0.880 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(6/9/2016) 
N.A0.310 0.691 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.230 0.770 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.100 0.900 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.160 0.840 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(7/23/2010) 
N.A0.090 0.910 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(6/9/2016) 
N.A0.287 0.713 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(6/9/2016) 
N.A0.174 0.826 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.450 0.550 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.210 0.790 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.140 0.860 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(6/9/2016) 
N.A0.263 0.737 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(6/9/2016) 
N.A0.191 0.809 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.220 0.780 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(7/23/2010) 
N.A0.310 0.690 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.330 0.670 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/4/2009) 
N.A0.389 0.611 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.330 0.670 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(7/23/2010) 
N.A0.180 0.820 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(6/9/2016) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(6/9/2016) 
N.A0.351 0.649 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(6/9/2016) 
N.A0.305 0.695 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.350 0.650 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(7/23/2010) 
N.A0.580 0.420 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(6/9/2016) 
N.A0.227 0.773 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.180 0.820 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(6/9/2016) 
N.A0.095 0.905 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.160 0.840 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.260 0.740 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(6/9/2016) 
N.A0.191 0.810 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.080 0.920 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.400 0.600 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(6/9/2016) 
N.A0.360 0.640 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(6/9/2016) 
N.A0.130 0.870 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(7/23/2010) 
N.A0.600 0.400 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(6/9/2016) 
N.A0.500 0.500 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(6/9/2016) 
N.A0.162 0.838 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan