ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs1193220

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(7/23/2010) 
N.A0.380 0.630 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(7/23/2010) 
N.A0.460 0.540 
Africa San
(SA001469U) 
12
(7/23/2010) 
N.A0.420 0.580 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(7/23/2010) 
N.A0.610 0.390 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.679 0.321 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.639 0.361 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(7/23/2010) 
N.A0.670 0.330 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.658 0.342 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.690 0.310 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.615 0.385 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.500 0.500 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.618 0.382 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.606 0.394 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.782 0.218 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.600 0.400 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.690 0.310 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(7/23/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(7/23/2010) 
N.A0.440 0.560 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(7/23/2010) 
N.A0.370 0.630 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.257 0.743 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(7/23/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.382 0.618 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.290 0.710 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.452 0.548 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.440 0.560 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.366 0.634 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.326 0.674 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.380 0.620 
Europe French
(SA001503J) 
58
(7/23/2010) 
N.A0.530 0.470 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.524 0.476 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.296 0.705 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(7/23/2010) 
N.A0.380 0.630 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.310 0.690 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.417 0.583 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(7/23/2010) 
N.A0.340 0.660 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.440 0.560 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.381 0.619 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.360 0.640 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.400 0.600 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(7/23/2010) 
N.A0.430 0.570 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.521 0.479 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.370 0.630 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.550 0.450 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.440 0.560 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.540 0.460 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.420 0.580 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.934 0.066 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.868 0.132 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(7/23/2010) 
N.A0.660 0.340 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.440 0.560 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.730 0.270 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.726 0.274 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.440 0.560 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(7/23/2010) 
N.A0.640 0.360 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.622 0.378 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.771 0.229 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.320 0.680 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(7/23/2010) 
N.A0.470 0.530 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.727 0.273 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.540 0.460 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.476 0.524 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.580 0.420 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.480 0.520 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.595 0.405 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.650 0.350 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.540 0.460 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.520 0.480 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.522 0.478 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(7/23/2010) 
N.A0.360 0.640 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.630 0.370 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.721 0.279 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan