ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs12089806

Locus Name: Cache domain containing 1


Geographic
Region		Population
(Sample UID)		Typed Sample
Size(2N)
(Entry Date)		Add.
info		Genotype
info		Allele Symbol
GT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 		16
(7/23/2010) 		 N.A0.440 0.560 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 		24
(7/23/2010) 		 N.A0.330 0.670 
Africa San
(SA001469U) 		12
(7/23/2010) 		 N.A0.750 0.250 
Africa Afro-Caribbeans
(SA004242M) 		192
(5/30/2018) 		 N.A0.323 0.677 
Africa Biaka
(SA002256P) 		62
(7/23/2010) 		 N.A0.530 0.470 
Africa Esan
(SA004248S) 		198
(5/30/2018) 		 N.A0.399 0.601 
Africa Hausa
(SA004363Q) 		56
(4/4/2016) 		 N.A0.339 0.661 
Africa Ibo
(SA004362P) 		72
(4/4/2016) 		 N.A0.444 0.556 
Africa Malinke
(SA004243N) 		226
(5/30/2018) 		 N.A0.385 0.615 
Africa Mbuti
(SA001466R) 		30
(7/23/2010) 		 N.A0.600 0.400 
Africa Mbuti
(SA004361O) 		38
(4/4/2016) 		 N.A0.684 0.316 
Africa Yoruba
(SA001468T) 		48
(7/23/2010) 		 N.A0.580 0.420 
Africa Yoruba
(SA004048Q) 		216
(5/30/2018) 		 N.A0.444 0.556 
Africa Chagga
(SA004365S) 		78
(4/4/2016) 		 N.A0.421 0.579 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 		62
(4/4/2016) 		 N.A0.161 0.839 
Africa Luhya
(SA004046O) 		198
(5/30/2018) 		 N.A0.394 0.606 
Africa Masai
(SA004364R) 		34
(4/4/2016) 		 N.A0.294 0.706 
Africa Sandawe
(SA004366T) 		66
(4/4/2016) 		 N.A0.136 0.864 
Africa Zaramo
(SA004367U) 		78
(4/4/2016) 		 N.A0.410 0.590 
Africa African Americans
(SA004369W) 		60
(4/4/2016) 		 N.A0.283 0.717 
Africa African Americans
(SA004047P) 		122
(5/30/2018) 		 N.A0.295 0.705 
Africa Mandenka
(SA001467S) 		48
(7/23/2010) 		 N.A0.460 0.540 
Africa Mende
(SA004244O) 		170
(5/30/2018) 		 N.A0.382 0.618 
Africa Mozabite
(SA001471N) 		60
(7/23/2010) 		 N.A0.070 0.930 
Asia Bedouin
(SA002254N) 		96
(7/23/2010) 		 N.A0.060 0.940 
Asia Druze
(SA002257Q) 		94
(7/23/2010) 		 N.A0.040 0.960 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 		74
(4/4/2016) 		 N.A0.068 0.932 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 		102
(7/23/2010) 		 N.A0.090 0.910 
Asia Samaritans
(SA004371P) 		76
(4/4/2016) 		 N.A0.079 0.921 
Europe Abkhaz
(SA004584V) 		52
(5/30/2018) 		 N.A0 1.000 
Europe Adygei
(SA001509P) 		34
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
Europe Adygei
(SA004373R) 		42
(4/4/2016) 		 N.A0.024 0.976 
Europe Adygei
(SA004585W) 		62
(5/30/2018) 		 N.A0.032 0.968 
Europe Bashkir
(SA004615Q) 		68
(5/30/2018) 		 N.A0.044 0.956 
Europe Basque
(SA001504K) 		48
(7/23/2010) 		 N.A0.040 0.960 
Europe Belarusian
(SA004586X) 		56
(5/30/2018) 		 N.A0.036 0.964 
Europe British
(SA004050J) 		182
(5/30/2018) 		 N.A0.038 0.962 
Europe Chechen
(SA004589A) 		36
(5/30/2018) 		 N.A0 1.000 
Europe Cherkess
(SA004588Z) 		66
(5/30/2018) 		 N.A0.015 0.985 
Europe Chuvash
(SA004374S) 		82
(4/4/2016) 		 N.A0.049 0.951 
Europe Chuvash
(SA004600K) 		56
(5/30/2018) 		 N.A0.036 0.964 
Europe Danes
(SA004392S) 		86
(4/4/2016) 		 N.A0.070 0.930 
Europe Estonian
(SA003028N) 		1950
(11/18/2009) 		 N.A0.027 0.973 
Europe European Americans
(SA004250L) 		198
(5/30/2018) 		 N.A0.056 0.944 
Europe Finns
(SA004377V) 		50
(4/4/2016) 		 N.A0.060 0.940 
Europe Finns
(SA004049R) 		198
(5/30/2018) 		 N.A0.051 0.949 
Europe French
(SA001503J) 		58
(7/23/2010) 		 N.A0.070 0.930 
Europe Hungarian
(SA004375T) 		82
(4/4/2016) 		 N.A0.049 0.951 
Europe Iberian
(SA004108N) 		214
(5/30/2018) 		 N.A0.037 0.963 
Europe Irish
(SA004378W) 		44
(4/4/2016) 		 N.A0.046 0.955 
Europe Italians
(SA001507N) 		16
(7/23/2010) 		 N.A0.060 0.940 
Europe Italians
(SA002255O) 		26
(7/23/2010) 		 N.A0.040 0.960 
Europe Italians
(SA004057Q) 		214
(5/30/2018) 		 N.A0.037 0.963 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 		48
(4/4/2016) 		 N.A0 1.000 
Europe Kabardinian
(SA004590S) 		70
(5/30/2018) 		 N.A0.043 0.957 
Europe Karachay
(SA004591T) 		46
(5/30/2018) 		 N.A0.043 0.957 
Europe Karelians
(SA004617S) 		52
(5/30/2018) 		 N.A0.058 0.942 
Europe Megrelians
(SA004623P) 		72
(5/30/2018) 		 N.A0.014 0.986 
Europe Moldovan
(SA004598A) 		64
(5/30/2018) 		 N.A0.016 0.984 
Europe Mordvin
(SA004599B) 		66
(5/30/2018) 		 N.A0.061 0.939 
Europe Orcadian
(SA001508O) 		32
(7/23/2010) 		 N.A0.060 0.940 
Europe Russians
(SA001510H) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.060 0.940 
Europe Russians
(SA004376U) 		42
(4/4/2016) 		 N.A0.071 0.929 
Europe Russians
(SA004601L) 		76
(5/30/2018) 		 N.A0.066 0.934 
Europe Russians
(SA004603N) 		78
(5/30/2018) 		 N.A0.051 0.949 
Europe Sardinian
(SA001505L) 		56
(7/23/2010) 		 N.A0.050 0.950 
Europe Tatar
(SA004604O) 		68
(5/30/2018) 		 N.A0.059 0.941 
Europe Udmurt
(SA004607R) 		50
(5/30/2018) 		 N.A0.040 0.960 
Europe Ukrainian
(SA004608S) 		58
(5/30/2018) 		 N.A0.052 0.948 
Asia Burusho
(SA001482P) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.040 0.960 
Asia Kalash
(SA001481O) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
Asia Pashtun
(SA002262M) 		46
(7/23/2010) 		 N.A0.020 0.980 
Asia Kazakh
(SA004593V) 		90
(5/30/2018) 		 N.A0.022 0.978 
Asia Khanty
(SA004380P) 		94
(4/4/2016) 		 N.A0.075 0.926 
Asia Khanty
(SA004595X) 		58
(5/30/2018) 		 N.A0.207 0.793 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 		92
(4/4/2016) 		 N.A0.022 0.978 
Asia Komi-Zyrian
(SA004596Y) 		64
(5/30/2018) 		 N.A0.016 0.984 
Asia Kyrgyz
(SA004597Z) 		56
(5/30/2018) 		 N.A0.036 0.964 
Asia Mongolian
(SA001489W) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0.100 0.900 
Asia Uzbek
(SA004609T) 		78
(5/30/2018) 		 N.A0.064 0.936 
Asia Balochi
(SA001476S) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.100 0.900 
Asia Balochi
(SA001478U) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.040 0.960 
Asia Bengali
(SA004239S) 		172
(5/30/2018) 		 N.A0.029 0.971 
Asia Brahui
(SA001475R) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.020 0.980 
Asia Gujarati
(SA004246Q) 		206
(5/30/2018) 		 N.A0.053 0.947 
Asia Hazara
(SA001477T) 		48
(7/23/2010) 		 N.A0.080 0.920 
Asia Punjabi
(SA004240K) 		192
(5/30/2018) 		 N.A0.036 0.964 
Asia Sindhi
(SA001479V) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.140 0.860 
Asia Tamil
(SA004241L) 		204
(5/30/2018) 		 N.A0.020 0.980 
Asia Telugu
(SA004247R) 		204
(5/30/2018) 		 N.A0.069 0.931 
EastAsia Ami
(SA004386V) 		76
(4/4/2016) 		 N.A0 1.000 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 		68
(4/4/2016) 		 N.A0 1.000 
EastAsia Dai
(SA001493R) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0.050 0.950 
EastAsia Dai
(SA004238R) 		196
(5/30/2018) 		 N.A0.038 0.962 
EastAsia Daur
(SA001488V) 		18
(7/23/2010) 		 N.A0.170 0.830 
EastAsia Han
(SA001483Q) 		88
(7/23/2010) 		 N.A0.080 0.920 
EastAsia Han
(SA004058R) 		206
(5/30/2018) 		 N.A0.068 0.932 
EastAsia Han
(SA004059S) 		210
(5/30/2018) 		 N.A0.033 0.967 
EastAsia Han
(SA004592U) 		26
(5/30/2018) 		 N.A0.115 0.885 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 		18
(7/23/2010) 		 N.A0.110 0.890 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 		56
(7/23/2010) 		 N.A0.140 0.860 
EastAsia Japanese
(SA004060K) 		208
(5/30/2018) 		 N.A0.120 0.880 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 		106
(10/5/2009) 		 N.A0.046 0.954 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
EastAsia Miao
(SA001486T) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0.050 0.950 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 		18
(7/23/2010) 		 N.A0.060 0.940 
Asia Oroqen
(SA001487U) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
EastAsia She
(SA001495T) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0.050 0.950 
EastAsia Tu
(SA001497V) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0.050 0.950 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0.050 0.950 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0.050 0.950 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 		18
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
EastAsia Yi
(SA001485S) 		20
(7/23/2010) 		 N.A0.150 0.850 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 		22
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 		30
(4/4/2016) 		 N.A0.133 0.867 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 		74
(4/4/2016) 		 N.A0.068 0.932 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 		118
(4/4/2016) 		 N.A0.042 0.958 
EastAsia Vietnamese
(SA004249T) 		202
(5/30/2018) 		 N.A0.035 0.965 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 		34
(7/23/2010) 		 N.A0.260 0.740 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 		38
(7/23/2010) 		 N.A0.450 0.550 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 		66
(4/4/2016) 		 N.A0.106 0.894 
Siberia Buryat
(SA004587Y) 		88
(5/30/2018) 		 N.A0.091 0.909 
Asia Ket
(SA004594W) 		62
(5/30/2018) 		 N.A0.016 0.984 
Siberia Tuva
(SA004605P) 		88
(5/30/2018) 		 N.A0.080 0.920 
Siberia Yakut
(SA001498W) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.040 0.960 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 		42
(4/4/2016) 		 N.A0.024 0.976 
Siberia Yakut
(SA004610L) 		82
(5/30/2018) 		 N.A0.061 0.939 
NorthAmerica Mexicans
(SA004110G) 		128
(5/30/2018) 		 N.A0.102 0.898 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.020 0.980 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 		50
(7/23/2010) 		 N.A0.060 0.940 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 		42
(4/4/2016) 		 N.A0.143 0.857 
NorthAmerica Puerto Rican
(SA004111H) 		208
(5/30/2018) 		 N.A0.130 0.870 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 		26
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
SouthAmerica Colombian
(SA004109O) 		188
(5/30/2018) 		 N.A0.059 0.941 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 		48
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 		50
(4/4/2016) 		 N.A0 1.000 
SouthAmerica Peruvian
(SA004245P) 		170
(5/30/2018) 		 N.A0.071 0.929 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 		46
(4/4/2016) 		 N.A0.044 0.957 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 		42
(7/23/2010) 		 N.A0 1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 		46
(4/4/2016) 		 N.A0 1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 		68
(4/4/2016) 		 N.A0.074 0.927 

Total Population Samples 141
Total Alleles: 2

© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan