ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs12119558

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa San
(SA001469U) 
12
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.018 0.982 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.026 0.974 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.065 0.936 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.029 0.971 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.117 0.883 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(7/23/2010) 
N.A0.170 0.830 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(7/23/2010) 
N.A0.180 0.820 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(7/23/2010) 
N.A0.330 0.670 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.392 0.608 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(7/23/2010) 
N.A0.320 0.680 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.263 0.737 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.350 0.650 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.238 0.762 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.366 0.634 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.372 0.628 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.320 0.680 
Europe French
(SA001503J) 
58
(7/23/2010) 
N.A0.360 0.640 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.281 0.720 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.432 0.568 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(7/23/2010) 
N.A0.130 0.880 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.460 0.540 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.438 0.563 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(7/23/2010) 
N.A0.470 0.530 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.320 0.680 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.333 0.667 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.380 0.630 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.160 0.840 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.200 0.800 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(7/23/2010) 
N.A0.170 0.830 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.287 0.713 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.500 0.500 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.150 0.850 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.160 0.840 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.160 0.840 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.140 0.860 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.230 0.770 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.053 0.947 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.088 0.912 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.060 0.940 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(7/23/2010) 
N.A0.230 0.770 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.148 0.852 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.220 0.780 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(7/23/2010) 
N.A0.090 0.910 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.067 0.933 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.338 0.662 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.178 0.822 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.620 0.380 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(7/23/2010) 
N.A0.500 0.500 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.303 0.697 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.140 0.860 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.191 0.810 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.180 0.820 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.340 0.660 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.357 0.643 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.190 0.810 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.150 0.850 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.300 0.700 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.304 0.696 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(7/23/2010) 
N.A0.640 0.360 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.370 0.630 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.279 0.721 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan