ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs12143319

Locus Name: chromosome 1 open reading frame 52


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(7/23/2010) 
N.A0.040 0.960 
Africa San
(SA001469U) 
12
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(7/23/2010) 
N.A0.020 0.980 
Africa Hausa
(SA003960S) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.040 0.960 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(4/14/2016) 
N.A0.036 0.964 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(4/14/2016) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(7/23/2010) 
N.A0.070 0.930 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(4/14/2016) 
N.A0.079 0.921 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.020 0.980 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(4/14/2016) 
N.A0.026 0.974 
Africa Jews, Ethiopian
(SA003973W) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.130 0.870 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(4/14/2016) 
N.A0.177 0.823 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(4/14/2016) 
N.A0.029 0.971 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(4/14/2016) 
N.A0.046 0.955 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(4/14/2016) 
N.A0.013 0.987 
Africa African Americans
(SA003982W) 
118
(2/27/2012) 
N.A0.220 0.780 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(4/14/2016) 
N.A0.050 0.950 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.040 0.960 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(7/23/2010) 
N.A0.040 0.960 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Asia Druze
(SA003961T) 
54
(2/27/2012) 
N.A0.130 0.870 
Asia Jews, Yemenite
(SA003959A) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.120 0.880 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(4/14/2016) 
N.A0.068 0.932 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(7/23/2010) 
N.A0.040 0.960 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(4/14/2016) 
N.A0.079 0.921 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.030 0.970 
Europe Adygei
(SA003974X) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.020 0.980 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(4/14/2016) 
N.A0.024 0.976 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.080 0.920 
Europe Chuvash
(SA003969B) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.140 0.860 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(4/14/2016) 
N.A0.146 0.854 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(4/14/2016) 
N.A0.093 0.907 
Europe European Americans
(SA003983X) 
96
(2/27/2012) 
N.A0.140 0.860 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(4/14/2016) 
N.A0.040 0.960 
Europe French
(SA001503J) 
58
(7/23/2010) 
N.A0.090 0.910 
Europe Hungarian
(SA003976Z) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.100 0.900 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(4/14/2016) 
N.A0.085 0.915 
Europe Irish
(SA003979C) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.040 0.960 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(4/14/2016) 
N.A0.023 0.977 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(7/23/2010) 
N.A0.130 0.880 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(7/23/2010) 
N.A0.080 0.920 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(4/14/2016) 
N.A0.021 0.979 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(7/23/2010) 
N.A0.030 0.970 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.040 0.960 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(4/14/2016) 
N.A0.071 0.929 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.110 0.890 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.040 0.960 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(7/23/2010) 
N.A1.000 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(7/23/2010) 
N.A0.130 0.870 
Asia Khanty
(SA003968A) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.330 0.670 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(4/14/2016) 
N.A0.245 0.755 
Asia Komi-Zyrian
(SA003962U) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.060 0.940 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(4/14/2016) 
N.A0.054 0.946 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.100 0.900 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.060 0.940 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.080 0.920 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(7/23/2010) 
N.A0.190 0.810 
Asia Keralite
(SA003963V) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.120 0.880 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.140 0.860 
EastAsia Ami
(SA003975Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.170 0.830 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(4/14/2016) 
N.A0.197 0.803 
EastAsia Atayal
(SA003971U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(4/14/2016) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.220 0.780 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(7/23/2010) 
N.A0.130 0.880 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.060 0.940 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(7/23/2010) 
N.A0.160 0.840 
EastAsia Japanese
(SA003972V) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.130 0.870 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.083 0.917 
EastAsia Koreans
(SA003958Z) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.080 0.920 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.060 0.940 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(7/23/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(7/23/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(7/23/2010) 
N.A0.180 0.820 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA003967Z) 
36
(2/27/2012) 
N.A0.170 0.830 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(4/14/2016) 
N.A0.233 0.767 
EastAsia Hakka
(SA003978B) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.020 0.980 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(4/14/2016) 
N.A0.135 0.865 
Asia Lao Loum
(SA003980U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.140 0.860 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(4/14/2016) 
N.A0.119 0.881 
Oceania Gimi
(SA003981V) 
30
(2/27/2012) 
N.A0.300 0.700 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(7/23/2010) 
N.A0.180 0.820 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(7/23/2010) 
N.A0.130 0.870 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA003966Y) 
34
(2/27/2012) 
N.A0.240 0.760 
Oceania Micronesians
(SA003977A) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.330 0.670 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(4/14/2016) 
N.A0.318 0.682 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.280 0.720 
Siberia Yakut
(SA003970T) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.310 0.690 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(4/14/2016) 
N.A0.357 0.643 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.060 0.940 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA003955W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.040 0.960 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(7/23/2010) 
N.A0.040 0.960 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA003964W) 
50
(2/27/2012) 
N.A1.000 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(4/14/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(7/23/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(7/23/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA003957Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(4/14/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA003965X) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.020 0.980 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(4/14/2016) 
N.A0.022 0.978 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(7/23/2010) 
N.A0.240 0.760 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(4/14/2016) 
N.A0.239 0.761 
SouthAmerica Ticuna
(SA003956X) 
50
(2/27/2012) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(4/14/2016) 
N.A1.000 

Total Population Samples 115
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan