ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs16830039

Locus Name: ATPase, H+ transporting, lysosomal 31kDa, V1 subunit E1 pseudogene 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
GT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa San
(SA001469U) 
12
(8/6/2010) 
N.A0.250 0.750 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(3/3/2016) 
N.A0.032 0.968 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(3/3/2016) 
N.A0.033 0.967 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(8/6/2010) 
N.A0.030 0.970 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(8/6/2010) 
N.A0.010 0.990 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(8/6/2010) 
N.A0.140 0.860 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(8/6/2010) 
N.A0.010 0.990 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(3/3/2016) 
N.A0.355 0.645 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(8/6/2010) 
N.A0.090 0.910 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(3/3/2016) 
N.A0.024 0.976 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.040 0.960 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(3/3/2016) 
N.A0.098 0.902 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(3/3/2016) 
N.A0.105 0.895 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(3/3/2016) 
N.A0.060 0.940 
Europe French
(SA001503J) 
58
(8/6/2010) 
N.A0.030 0.970 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(3/3/2016) 
N.A0.061 0.939 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(3/3/2016) 
N.A0.046 0.955 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(8/6/2010) 
N.A0.150 0.850 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(3/3/2016) 
N.A1.000 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(8/6/2010) 
N.A0.090 0.910 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.060 0.940 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(3/3/2016) 
N.A0.024 0.976 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(8/6/2010) 
N.A0.040 0.960 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.160 0.840 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.180 0.820 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(8/6/2010) 
N.A0.110 0.890 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(3/3/2016) 
N.A0.181 0.819 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(3/3/2016) 
N.A0.022 0.978 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.300 0.700 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.060 0.940 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.060 0.940 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.080 0.920 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.020 0.980 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(3/3/2016) 
N.A0.145 0.855 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(3/3/2016) 
N.A0.544 0.456 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(8/6/2010) 
N.A0.260 0.740 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.170 0.830 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(8/6/2010) 
N.A0.380 0.630 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.194 0.806 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.060 0.940 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.220 0.780 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(8/6/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(3/3/2016) 
N.A0.433 0.567 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(3/3/2016) 
N.A0.297 0.703 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(3/3/2016) 
N.A0.271 0.729 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(8/6/2010) 
N.A0.500 0.500 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(8/6/2010) 
N.A0.320 0.680 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(3/3/2016) 
N.A0.333 0.667 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.200 0.800 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(3/3/2016) 
N.A0.286 0.714 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.660 0.340 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.620 0.380 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(3/3/2016) 
N.A0.429 0.571 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(8/6/2010) 
N.A0.580 0.420 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.460 0.540 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(3/3/2016) 
N.A0.460 0.540 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(3/3/2016) 
N.A0.522 0.478 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(8/6/2010) 
N.A0.830 0.170 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(3/3/2016) 
N.A0.804 0.196 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(3/3/2016) 
N.A0.500 0.500 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan