ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs16839450

Locus Name: adherens junctions associated protein 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(8/6/2010) 
N.A0.940 0.060 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(8/6/2010) 
N.A0.960 0.040 
Africa San
(SA001469U) 
12
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(8/6/2010) 
N.A1.000 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/16/2016) 
N.A0.929 0.071 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/16/2016) 
N.A0.958 0.042 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(8/6/2010) 
N.A0.900 0.100 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/16/2016) 
N.A0.895 0.105 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.960 0.040 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/16/2016) 
N.A0.949 0.051 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/16/2016) 
N.A0.807 0.194 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/16/2016) 
N.A0.882 0.118 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/16/2016) 
N.A0.894 0.106 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/16/2016) 
N.A0.936 0.064 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/16/2016) 
N.A0.900 0.100 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(8/6/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(8/6/2010) 
N.A0.800 0.200 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(8/6/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/16/2016) 
N.A0.824 0.176 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(8/6/2010) 
N.A0.760 0.240 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/16/2016) 
N.A0.724 0.276 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(8/6/2010) 
N.A0.740 0.260 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/16/2016) 
N.A0.738 0.262 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.900 0.100 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/16/2016) 
N.A0.781 0.220 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/16/2016) 
N.A0.814 0.186 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/16/2016) 
N.A0.860 0.140 
Europe French
(SA001503J) 
58
(8/6/2010) 
N.A0.790 0.210 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/16/2016) 
N.A0.829 0.171 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/16/2016) 
N.A0.796 0.205 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(8/6/2010) 
N.A0.750 0.250 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(8/6/2010) 
N.A0.650 0.350 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/16/2016) 
N.A0.833 0.167 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(8/6/2010) 
N.A0.810 0.190 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.840 0.160 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/16/2016) 
N.A0.738 0.262 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(8/6/2010) 
N.A0.930 0.070 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.720 0.280 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(8/6/2010) 
N.A0.740 0.260 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/16/2016) 
N.A0.628 0.372 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/16/2016) 
N.A0.620 0.380 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.600 0.400 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.760 0.240 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.660 0.340 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.750 0.250 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.840 0.160 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/16/2016) 
N.A0.763 0.237 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/16/2016) 
N.A0.838 0.162 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(8/6/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(8/6/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.778 0.222 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.670 0.330 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(8/6/2010) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(8/6/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(8/6/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/16/2016) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/16/2016) 
N.A0.811 0.189 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/16/2016) 
N.A0.763 0.237 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(8/6/2010) 
N.A0.940 0.060 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(8/6/2010) 
N.A0.680 0.320 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/16/2016) 
N.A0.788 0.212 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.660 0.340 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/16/2016) 
N.A0.667 0.333 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.960 0.040 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(8/6/2010) 
N.A0.960 0.040 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/16/2016) 
N.A0.857 0.143 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(8/6/2010) 
N.A0.920 0.080 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(8/6/2010) 
N.A0.830 0.170 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/16/2016) 
N.A0.880 0.120 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/16/2016) 
N.A0.891 0.109 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(8/6/2010) 
N.A0.620 0.380 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/16/2016) 
N.A0.739 0.261 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/16/2016) 
N.A0.956 0.044 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan