ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs1725235

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(8/27/2010) 
N.A0.690 0.310 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(8/27/2010) 
N.A0.580 0.420 
Africa San
(SA001469U) 
12
(8/27/2010) 
N.A0.670 0.330 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(8/27/2010) 
N.A0.450 0.550 
Africa Hausa
(SA003960S) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.500 0.500 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.500 0.500 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.514 0.486 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(8/27/2010) 
N.A0.500 0.500 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.421 0.579 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.500 0.500 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.615 0.385 
Africa Jews, Ethiopian
(SA003973W) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.460 0.540 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.387 0.613 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.294 0.706 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.621 0.379 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.526 0.474 
Africa African Americans
(SA003982W) 
118
(2/27/2012) 
N.A0.420 0.580 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.617 0.383 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.560 0.440 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(8/27/2010) 
N.A0.600 0.400 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(8/27/2010) 
N.A0.330 0.670 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(8/27/2010) 
N.A0.330 0.670 
Asia Druze
(SA003961T) 
54
(2/27/2012) 
N.A0.280 0.720 
Asia Jews, Yemenite
(SA003959A) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.240 0.760 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.311 0.689 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(8/27/2010) 
N.A0.340 0.660 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.132 0.868 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(8/27/2010) 
N.A0.380 0.620 
Europe Adygei
(SA003974X) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.340 0.660 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.310 0.691 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.520 0.480 
Europe Chuvash
(SA003969B) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.260 0.740 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.329 0.671 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.407 0.593 
Europe European Americans
(SA003983X) 
96
(2/27/2012) 
N.A0.360 0.640 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.260 0.740 
Europe French
(SA001503J) 
58
(8/27/2010) 
N.A0.330 0.670 
Europe Hungarian
(SA003976Z) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.340 0.660 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.317 0.683 
Europe Irish
(SA003979C) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.400 0.600 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.296 0.705 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(8/27/2010) 
N.A0.380 0.630 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(8/27/2010) 
N.A0.310 0.690 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.417 0.583 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(8/27/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.340 0.660 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.405 0.595 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.230 0.770 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.320 0.680 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.180 0.820 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(8/27/2010) 
N.A0.240 0.760 
Asia Khanty
(SA003968A) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.260 0.740 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.266 0.734 
Asia Komi-Zyrian
(SA003962U) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.420 0.580 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.435 0.565 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.200 0.800 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.300 0.700 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.180 0.820 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.350 0.650 
Asia Keralite
(SA003963V) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.220 0.780 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.140 0.860 
EastAsia Ami
(SA003975Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.382 0.618 
EastAsia Atayal
(SA003971U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.406 0.594 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(8/27/2010) 
N.A0.590 0.410 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.380 0.630 
EastAsia Japanese
(SA003972V) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.583 0.417 
EastAsia Koreans
(SA003958Z) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.540 0.460 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.390 0.610 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(8/27/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA003967Z) 
36
(2/27/2012) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.467 0.533 
EastAsia Hakka
(SA003978B) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.500 0.500 
Asia Lao Loum
(SA003980U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.620 0.380 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.627 0.373 
Oceania Gimi
(SA003981V) 
30
(2/27/2012) 
N.A0.670 0.330 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(8/27/2010) 
N.A0.710 0.290 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(8/27/2010) 
N.A0.580 0.420 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA003966Y) 
34
(2/27/2012) 
N.A0.590 0.410 
Oceania Micronesians
(SA003977A) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.650 0.350 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.636 0.364 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.520 0.480 
Siberia Yakut
(SA003970T) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.560 0.440 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.619 0.381 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.300 0.700 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA003955W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.340 0.660 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.320 0.680 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA003964W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.480 0.520 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.452 0.548 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(8/27/2010) 
N.A0.500 0.500 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.480 0.520 
SouthAmerica Karitiana
(SA003957Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.460 0.540 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.460 0.540 
SouthAmerica Quechua
(SA003965X) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.570 0.430 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.565 0.435 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(8/27/2010) 
N.A0.810 0.190 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.587 0.413 
SouthAmerica Ticuna
(SA003956X) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.280 0.720 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.265 0.735 

Total Population Samples 115
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan