ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs17350193

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Africa San
(SA001469U) 
12
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.964 0.036 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.960 0.040 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.962 0.039 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.984 0.016 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.971 0.029 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.962 0.039 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.983 0.017 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(8/27/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(8/27/2010) 
N.A0.830 0.170 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(8/27/2010) 
N.A0.970 0.030 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.973 0.027 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(8/27/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.934 0.066 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.980 0.020 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.976 0.024 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.942 0.058 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.920 0.080 
Europe French
(SA001503J) 
58
(8/27/2010) 
N.A0.930 0.070 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.976 0.024 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.955 0.046 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(8/27/2010) 
N.A0.940 0.060 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.958 0.042 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(8/27/2010) 
N.A0.970 0.030 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.920 0.080 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.976 0.024 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.910 0.090 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.980 0.020 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(8/27/2010) 
N.A0.980 0.020 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.957 0.044 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.960 0.040 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.960 0.040 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.960 0.040 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A1.000 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A1.000 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A1.000 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A1.000 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A1.000 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(8/27/2010) 
N.A1.000 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.980 0.020 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.976 0.024 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(8/27/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(8/27/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(8/27/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A1.000 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan