ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs1876848

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(8/27/2010) 
N.A0.310 0.690 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(8/27/2010) 
N.A0.330 0.670 
Africa San
(SA001469U) 
12
(8/27/2010) 
N.A0.830 0.170 
Africa Afro-Caribbeans
(SA004242M) 
192
(5/23/2018) 
N.A0.292 0.708 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(8/27/2010) 
N.A0.520 0.480 
Africa Esan
(SA004248S) 
198
(5/23/2018) 
N.A0.323 0.677 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.357 0.643 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.389 0.611 
Africa Malinke
(SA004243N) 
226
(5/23/2018) 
N.A0.358 0.642 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(8/27/2010) 
N.A0.630 0.370 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.605 0.395 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.350 0.650 
Africa Yoruba
(SA004048Q) 
216
(5/23/2018) 
N.A0.319 0.681 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.333 0.667 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.484 0.516 
Africa Luhya
(SA004046O) 
198
(5/23/2018) 
N.A0.323 0.677 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.177 0.824 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.182 0.818 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.192 0.808 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.383 0.617 
Africa African Americans
(SA004047P) 
122
(5/23/2018) 
N.A0.279 0.721 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.270 0.730 
Africa Mende
(SA004244O) 
170
(5/23/2018) 
N.A0.282 0.718 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(8/27/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(8/27/2010) 
N.A0.330 0.670 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(8/27/2010) 
N.A0.230 0.770 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.095 0.905 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(8/27/2010) 
N.A0.170 0.830 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.092 0.908 
Europe Abkhaz
(SA004584V) 
52
(5/23/2018) 
N.A0.096 0.904 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(8/27/2010) 
N.A0.150 0.850 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.167 0.833 
Europe Adygei
(SA004585W) 
62
(5/23/2018) 
N.A0.194 0.806 
Europe Bashkir
(SA004615Q) 
68
(5/23/2018) 
N.A0.147 0.853 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.080 0.920 
Europe Belarusian
(SA004586X) 
56
(5/23/2018) 
N.A0.232 0.768 
Europe British
(SA004050J) 
182
(5/23/2018) 
N.A0.220 0.780 
Europe Chechen
(SA004589A) 
36
(5/23/2018) 
N.A0.222 0.778 
Europe Cherkess
(SA004588Z) 
66
(5/23/2018) 
N.A0.167 0.833 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.256 0.744 
Europe Chuvash
(SA004600K) 
56
(5/23/2018) 
N.A0.179 0.821 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.244 0.756 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1952
(11/18/2009) 
N.A0.194 0.806 
Europe European Americans
(SA004250L) 
198
(5/23/2018) 
N.A0.197 0.803 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.180 0.820 
Europe Finns
(SA004049R) 
198
(5/23/2018) 
N.A0.192 0.808 
Europe French
(SA001503J) 
58
(8/27/2010) 
N.A0.140 0.860 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.110 0.890 
Europe Iberian
(SA004108N) 
214
(5/23/2018) 
N.A0.140 0.860 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.159 0.841 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(8/27/2010) 
N.A0.130 0.880 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(8/27/2010) 
N.A0.150 0.850 
Europe Italians
(SA004057Q) 
214
(5/23/2018) 
N.A0.187 0.813 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.104 0.896 
Europe Kabardinian
(SA004590S) 
70
(5/23/2018) 
N.A0.171 0.829 
Europe Karachay
(SA004591T) 
46
(5/23/2018) 
N.A0.239 0.761 
Europe Karelians
(SA004617S) 
52
(5/23/2018) 
N.A0.192 0.808 
Europe Megrelians
(SA004623P) 
72
(5/23/2018) 
N.A0.125 0.875 
Europe Moldovan
(SA004598A) 
64
(5/23/2018) 
N.A0.125 0.875 
Europe Mordvin
(SA004599B) 
66
(5/23/2018) 
N.A0.303 0.697 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(8/27/2010) 
N.A0.380 0.630 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.240 0.760 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.143 0.857 
Europe Russians
(SA004601L) 
76
(5/23/2018) 
N.A0.224 0.776 
Europe Russians
(SA004603N) 
78
(5/23/2018) 
N.A0.205 0.795 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.110 0.890 
Europe Tatar
(SA004604O) 
68
(5/23/2018) 
N.A0.191 0.809 
Europe Udmurt
(SA004607R) 
50
(5/23/2018) 
N.A0.220 0.780 
Europe Ukrainian
(SA004608S) 
58
(5/23/2018) 
N.A0.121 0.879 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.340 0.660 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.080 0.920 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(8/27/2010) 
N.A0.260 0.740 
Asia Kazakh
(SA004593V) 
90
(5/23/2018) 
N.A0.167 0.833 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.170 0.830 
Asia Khanty
(SA004595X) 
58
(5/23/2018) 
N.A0.190 0.810 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.141 0.859 
Asia Komi-Zyrian
(SA004596Y) 
64
(5/23/2018) 
N.A0.156 0.844 
Asia Kyrgyz
(SA004597Z) 
56
(5/23/2018) 
N.A0.214 0.786 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.350 0.650 
Asia Uzbek
(SA004609T) 
78
(5/23/2018) 
N.A0.231 0.769 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.140 0.860 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.200 0.800 
Asia Bengali
(SA004239S) 
172
(5/23/2018) 
N.A0.221 0.779 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.220 0.780 
Asia Gujarati
(SA004246Q) 
206
(5/23/2018) 
N.A0.223 0.777 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.190 0.810 
Asia Punjabi
(SA004240K) 
192
(5/23/2018) 
N.A0.162 0.838 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.280 0.720 
Asia Tamil
(SA004241L) 
204
(5/23/2018) 
N.A0.211 0.789 
Asia Telugu
(SA004247R) 
204
(5/23/2018) 
N.A0.186 0.814 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.395 0.605 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.338 0.662 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Dai
(SA004238R) 
196
(5/23/2018) 
N.A0.328 0.672 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(8/27/2010) 
N.A0.220 0.780 
EastAsia Han
(SA004058R) 
206
(5/23/2018) 
N.A0.282 0.718 
EastAsia Han
(SA004059S) 
210
(5/23/2018) 
N.A0.324 0.676 
EastAsia Han
(SA004592U) 
26
(5/23/2018) 
N.A0.167 0.833 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.270 0.730 
EastAsia Japanese
(SA004060K) 
208
(5/23/2018) 
N.A0.322 0.678 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/5/2009) 
N.A0.417 0.583 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.110 0.890 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.280 0.720 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(8/27/2010) 
N.A0.270 0.730 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.133 0.867 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.324 0.676 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.331 0.670 
EastAsia Vietnamese
(SA004249T) 
202
(5/23/2018) 
N.A0.222 0.778 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(8/27/2010) 
N.A0.680 0.320 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(8/27/2010) 
N.A0.610 0.390 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.379 0.621 
Siberia Buryat
(SA004587Y) 
88
(5/23/2018) 
N.A0.307 0.693 
Asia Ket
(SA004594W) 
62
(5/23/2018) 
N.A0.177 0.823 
Siberia Tuva
(SA004605P) 
88
(5/23/2018) 
N.A0.318 0.682 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.180 0.820 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.262 0.738 
Siberia Yakut
(SA004610L) 
82
(5/23/2018) 
N.A0.256 0.744 
NorthAmerica Mexicans
(SA004110G) 
128
(5/23/2018) 
N.A0.109 0.891 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.120 0.880 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.060 0.940 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.048 0.952 
NorthAmerica Puerto Rican
(SA004111H) 
208
(5/23/2018) 
N.A0.101 0.899 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(8/27/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Colombian
(SA004109O) 
188
(5/23/2018) 
N.A0.192 0.808 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(8/27/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Peruvian
(SA004245P) 
170
(5/23/2018) 
N.A0.082 0.918 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.022 0.978 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(8/27/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A1.000 

Total Population Samples 141
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan