ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs2056675

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(8/27/2010) 
N.A0.560 0.440 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(8/27/2010) 
N.A0.750 0.250 
Africa San
(SA001469U) 
12
(8/27/2010) 
N.A0.330 0.670 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(8/27/2010) 
N.A0.420 0.580 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.571 0.429 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.583 0.417 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(8/27/2010) 
N.A0.300 0.700 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.395 0.605 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.710 0.290 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.590 0.410 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.807 0.194 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.559 0.441 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.391 0.609 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.564 0.436 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.600 0.400 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.630 0.380 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(8/27/2010) 
N.A0.870 0.130 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(8/27/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(8/27/2010) 
N.A0.870 0.130 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.960 0.041 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(8/27/2010) 
N.A0.860 0.140 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.803 0.197 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(8/27/2010) 
N.A0.850 0.150 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.691 0.310 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.960 0.040 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.817 0.183 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.884 0.116 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.880 0.120 
Europe French
(SA001503J) 
58
(8/27/2010) 
N.A0.860 0.140 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.890 0.110 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.841 0.159 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(8/27/2010) 
N.A0.850 0.150 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.938 0.063 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(8/27/2010) 
N.A0.880 0.130 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.860 0.140 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.952 0.048 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.890 0.110 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(8/27/2010) 
N.A0.830 0.170 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.766 0.234 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.826 0.174 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.880 0.120 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.880 0.120 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.920 0.080 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.987 0.013 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.985 0.015 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(8/27/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.720 0.280 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(8/27/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.880 0.120 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.890 0.110 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(8/27/2010) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(8/27/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(8/27/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.933 0.067 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.919 0.081 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.958 0.042 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
32
(8/27/2010) 
N.A1.000 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(8/27/2010) 
N.A0.870 0.130 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.909 0.091 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.660 0.340 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.691 0.310 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.820 0.180 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(8/27/2010) 
N.A0.880 0.120 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.929 0.071 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(8/27/2010) 
N.A0.770 0.230 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(8/27/2010) 
N.A0.980 0.020 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.957 0.044 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(8/27/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.913 0.087 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.750 0.250 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan