ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs2375699

Locus Name: DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 6


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(9/10/2010) 
N.A0.440 0.560 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(9/10/2010) 
N.A0.460 0.540 
Africa San
(SA001469U) 
12
(9/10/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa Afro-Caribbeans
(SA004242M) 
192
(5/30/2018) 
N.A0.391 0.609 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(9/10/2010) 
N.A0.790 0.210 
Africa Esan
(SA004248S) 
198
(5/30/2018) 
N.A0.449 0.551 
Africa Hausa
(SA003960S) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.400 0.600 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(4/4/2016) 
N.A0.446 0.554 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(4/4/2016) 
N.A0.528 0.472 
Africa Malinke
(SA004243N) 
226
(5/30/2018) 
N.A0.469 0.531 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(9/10/2010) 
N.A0.630 0.370 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(4/4/2016) 
N.A0.842 0.158 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.380 0.630 
Africa Yoruba
(SA004048Q) 
216
(5/30/2018) 
N.A0.449 0.551 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(4/4/2016) 
N.A0.513 0.487 
Africa Jews, Ethiopian
(SA003973W) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.600 0.400 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(4/4/2016) 
N.A0.629 0.371 
Africa Luhya
(SA004046O) 
198
(5/30/2018) 
N.A0.505 0.495 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(4/4/2016) 
N.A0.441 0.559 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(4/4/2016) 
N.A0.652 0.349 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(4/4/2016) 
N.A0.410 0.590 
Africa African Americans
(SA003982W) 
118
(2/27/2012) 
N.A0.390 0.610 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(4/4/2016) 
N.A0.417 0.583 
Africa African Americans
(SA004047P) 
122
(5/30/2018) 
N.A0.549 0.451 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.420 0.580 
Africa Mende
(SA004244O) 
170
(5/30/2018) 
N.A0.500 0.500 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(9/10/2010) 
N.A0.600 0.400 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(9/10/2010) 
N.A0.450 0.550 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(9/10/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Druze
(SA003961T) 
54
(2/27/2012) 
N.A0.440 0.560 
Asia Jews, Yemenite
(SA003959A) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.420 0.580 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(4/4/2016) 
N.A0.338 0.662 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(9/10/2010) 
N.A0.550 0.450 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(4/4/2016) 
N.A0.158 0.842 
Europe Abkhaz
(SA004584V) 
52
(5/30/2018) 
N.A0.500 0.500 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(9/10/2010) 
N.A0.650 0.350 
Europe Adygei
(SA003974X) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.480 0.520 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(4/4/2016) 
N.A0.476 0.524 
Europe Adygei
(SA004585W) 
62
(5/30/2018) 
N.A0.468 0.532 
Europe Bashkir
(SA004615Q) 
68
(5/30/2018) 
N.A0.544 0.456 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.350 0.650 
Europe Belarusian
(SA004586X) 
56
(5/30/2018) 
N.A0.446 0.554 
Europe British
(SA004050J) 
182
(5/30/2018) 
N.A0.456 0.544 
Europe Chechen
(SA004589A) 
36
(5/30/2018) 
N.A0.500 0.500 
Europe Cherkess
(SA004588Z) 
66
(5/30/2018) 
N.A0.621 0.379 
Europe Chuvash
(SA003969B) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.700 0.300 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(4/4/2016) 
N.A0.610 0.390 
Europe Chuvash
(SA004600K) 
56
(5/30/2018) 
N.A0.607 0.393 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(4/4/2016) 
N.A0.407 0.593 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1952
(11/18/2009) 
N.A0.536 0.464 
Europe European Americans
(SA003983X) 
96
(2/27/2012) 
N.A0.370 0.630 
Europe European Americans
(SA004250L) 
198
(5/30/2018) 
N.A0.434 0.566 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(4/4/2016) 
N.A0.740 0.260 
Europe Finns
(SA004049R) 
198
(5/30/2018) 
N.A0.561 0.439 
Europe French
(SA001503J) 
58
(9/10/2010) 
N.A0.450 0.550 
Europe Hungarian
(SA003976Z) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.520 0.480 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(4/4/2016) 
N.A0.451 0.549 
Europe Iberian
(SA004108N) 
214
(5/30/2018) 
N.A0.397 0.603 
Europe Irish
(SA003979C) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.370 0.630 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(4/4/2016) 
N.A0.568 0.432 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(9/10/2010) 
N.A0.310 0.690 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(9/10/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Italians
(SA004057Q) 
214
(5/30/2018) 
N.A0.439 0.561 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(4/4/2016) 
N.A0.396 0.604 
Europe Kabardinian
(SA004590S) 
70
(5/30/2018) 
N.A0.486 0.514 
Europe Karachay
(SA004591T) 
46
(5/30/2018) 
N.A0.587 0.413 
Europe Karelians
(SA004617S) 
52
(5/30/2018) 
N.A0.673 0.327 
Europe Megrelians
(SA004623P) 
72
(5/30/2018) 
N.A0.486 0.514 
Europe Moldovan
(SA004598A) 
64
(5/30/2018) 
N.A0.437 0.563 
Europe Mordvin
(SA004599B) 
66
(5/30/2018) 
N.A0.651 0.349 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(9/10/2010) 
N.A0.440 0.560 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.460 0.540 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(4/4/2016) 
N.A0.643 0.357 
Europe Russians
(SA004601L) 
76
(5/30/2018) 
N.A0.553 0.447 
Europe Russians
(SA004603N) 
78
(5/30/2018) 
N.A0.641 0.359 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(9/10/2010) 
N.A0.390 0.610 
Europe Tatar
(SA004604O) 
68
(5/30/2018) 
N.A0.588 0.412 
Europe Udmurt
(SA004607R) 
50
(5/30/2018) 
N.A0.620 0.380 
Europe Ukrainian
(SA004608S) 
58
(5/30/2018) 
N.A0.414 0.586 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(9/10/2010) 
N.A0.540 0.460 
Asia Kazakh
(SA004593V) 
90
(5/30/2018) 
N.A0.633 0.367 
Asia Khanty
(SA003968A) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.700 0.300 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(4/4/2016) 
N.A0.649 0.351 
Asia Khanty
(SA004595X) 
58
(5/30/2018) 
N.A0.690 0.310 
Asia Komi-Zyrian
(SA003962U) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.690 0.310 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(4/4/2016) 
N.A0.652 0.348 
Asia Komi-Zyrian
(SA004596Y) 
64
(5/30/2018) 
N.A0.578 0.422 
Asia Kyrgyz
(SA004597Z) 
56
(5/30/2018) 
N.A0.696 0.304 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Uzbek
(SA004609T) 
78
(5/30/2018) 
N.A0.603 0.397 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.580 0.420 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Bengali
(SA004239S) 
172
(5/30/2018) 
N.A0.715 0.285 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Gujarati
(SA004246Q) 
206
(5/30/2018) 
N.A0.592 0.408 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.580 0.420 
Asia Keralite
(SA003963V) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.800 0.200 
Asia Punjabi
(SA004240K) 
192
(5/30/2018) 
N.A0.635 0.365 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.600 0.400 
Asia Tamil
(SA004241L) 
204
(5/30/2018) 
N.A0.598 0.402 
Asia Telugu
(SA004247R) 
204
(5/30/2018) 
N.A0.603 0.397 
EastAsia Ami
(SA003975Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(4/4/2016) 
N.A0.579 0.421 
EastAsia Atayal
(SA003971U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.680 0.320 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(4/4/2016) 
N.A0.691 0.309 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Dai
(SA004238R) 
196
(5/30/2018) 
N.A0.704 0.296 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.780 0.220 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(9/10/2010) 
N.A0.720 0.280 
EastAsia Han
(SA004058R) 
206
(5/30/2018) 
N.A0.689 0.311 
EastAsia Han
(SA004059S) 
210
(5/30/2018) 
N.A0.667 0.333 
EastAsia Han
(SA004592U) 
26
(5/30/2018) 
N.A0.654 0.346 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(9/10/2010) 
N.A0.660 0.340 
EastAsia Japanese
(SA003972V) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.690 0.310 
EastAsia Japanese
(SA004060K) 
208
(5/30/2018) 
N.A0.615 0.385 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.694 0.306 
EastAsia Koreans
(SA003958Z) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.620 0.380 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.670 0.330 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(9/10/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(9/10/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(9/10/2010) 
N.A0.640 0.360 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA003967Z) 
36
(2/27/2012) 
N.A0.640 0.360 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(4/4/2016) 
N.A0.633 0.367 
EastAsia Hakka
(SA003978B) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.730 0.270 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(4/4/2016) 
N.A0.649 0.351 
Asia Lao Loum
(SA003980U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.460 0.540 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(4/4/2016) 
N.A0.602 0.398 
EastAsia Vietnamese
(SA004249T) 
202
(5/30/2018) 
N.A0.636 0.364 
Oceania Gimi
(SA003981V) 
30
(2/27/2012) 
N.A0.600 0.400 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(9/10/2010) 
N.A0.710 0.290 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(9/10/2010) 
N.A0.840 0.160 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA003966Y) 
34
(2/27/2012) 
N.A0.790 0.210 
Oceania Micronesians
(SA003977A) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.500 0.500 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(4/4/2016) 
N.A0.439 0.561 
Siberia Buryat
(SA004587Y) 
88
(5/30/2018) 
N.A0.784 0.216 
Asia Ket
(SA004594W) 
62
(5/30/2018) 
N.A0.645 0.355 
Siberia Tuva
(SA004605P) 
88
(5/30/2018) 
N.A0.670 0.330 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.780 0.220 
Siberia Yakut
(SA003970T) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.730 0.270 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(4/4/2016) 
N.A0.738 0.262 
Siberia Yakut
(SA004610L) 
82
(5/30/2018) 
N.A0.768 0.232 
NorthAmerica Mexicans
(SA004110G) 
128
(5/30/2018) 
N.A0.664 0.336 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.700 0.300 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA003955W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.740 0.260 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(9/10/2010) 
N.A0.860 0.140 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA003964W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.920 0.080 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(4/4/2016) 
N.A0.905 0.095 
NorthAmerica Puerto Rican
(SA004111H) 
208
(5/30/2018) 
N.A0.538 0.462 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(9/10/2010) 
N.A0.960 0.040 
SouthAmerica Colombian
(SA004109O) 
188
(5/30/2018) 
N.A0.553 0.447 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(9/10/2010) 
N.A0.960 0.040 
SouthAmerica Karitiana
(SA003957Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.960 0.040 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(4/4/2016) 
N.A0.960 0.040 
SouthAmerica Peruvian
(SA004245P) 
170
(5/30/2018) 
N.A0.794 0.206 
SouthAmerica Quechua
(SA003965X) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.870 0.130 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(4/4/2016) 
N.A0.870 0.130 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(9/10/2010) 
N.A0.930 0.070 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(4/4/2016) 
N.A0.826 0.174 
SouthAmerica Ticuna
(SA003956X) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.840 0.160 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(4/4/2016) 
N.A0.809 0.191 

Total Population Samples 170
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan