ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs2873096

Locus Name: GLIS family zinc finger 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
GT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(9/17/2010) 
N.A0.440 0.560 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(9/17/2010) 
N.A0.330 0.670 
Africa San
(SA001469U) 
12
(9/17/2010) 
N.A0.330 0.670 
Africa Afro-Caribbeans
(SA004242M) 
192
(5/29/2018) 
N.A0.708 0.292 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(9/17/2010) 
N.A0.680 0.320 
Africa Esan
(SA004248S) 
198
(5/29/2018) 
N.A0.636 0.364 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(3/8/2016) 
N.A0.625 0.375 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(3/8/2016) 
N.A0.667 0.333 
Africa Malinke
(SA004243N) 
226
(5/29/2018) 
N.A0.540 0.460 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(9/17/2010) 
N.A0.730 0.270 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(3/8/2016) 
N.A0.842 0.158 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.690 0.310 
Africa Yoruba
(SA004048Q) 
216
(5/29/2018) 
N.A0.611 0.389 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(3/8/2016) 
N.A0.654 0.346 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(3/8/2016) 
N.A0.597 0.403 
Africa Luhya
(SA004046O) 
198
(5/29/2018) 
N.A0.606 0.394 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(3/8/2016) 
N.A0.588 0.412 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(3/8/2016) 
N.A0.788 0.212 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(3/8/2016) 
N.A0.539 0.462 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(3/8/2016) 
N.A0.533 0.467 
Africa African Americans
(SA004047P) 
122
(5/29/2018) 
N.A0.729 0.271 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.580 0.420 
Africa Mende
(SA004244O) 
170
(5/29/2018) 
N.A0.606 0.394 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(9/17/2010) 
N.A0.800 0.200 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(9/17/2010) 
N.A0.670 0.330 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(9/17/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(3/8/2016) 
N.A0.797 0.203 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(9/17/2010) 
N.A0.860 0.140 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(3/8/2016) 
N.A0.816 0.184 
Europe Abkhaz
(SA004584V) 
52
(5/29/2018) 
N.A0.885 0.115 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(9/17/2010) 
N.A0.820 0.180 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(3/8/2016) 
N.A0.952 0.048 
Europe Adygei
(SA004585W) 
62
(5/29/2018) 
N.A0.887 0.113 
Europe Bashkir
(SA004615Q) 
68
(5/29/2018) 
N.A0.912 0.088 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.810 0.190 
Europe Belarusian
(SA004586X) 
56
(5/29/2018) 
N.A0.804 0.196 
Europe British
(SA004050J) 
182
(5/29/2018) 
N.A0.835 0.165 
Europe Chechen
(SA004589A) 
36
(5/29/2018) 
N.A0.889 0.111 
Europe Cherkess
(SA004588Z) 
66
(5/29/2018) 
N.A0.894 0.106 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(3/8/2016) 
N.A0.842 0.159 
Europe Chuvash
(SA004600K) 
56
(5/29/2018) 
N.A0.821 0.179 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(3/8/2016) 
N.A0.814 0.186 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1952
(11/18/2009) 
N.A0.826 0.174 
Europe European Americans
(SA004250L) 
198
(5/29/2018) 
N.A0.833 0.167 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(3/8/2016) 
N.A0.960 0.040 
Europe Finns
(SA004049R) 
198
(5/29/2018) 
N.A0.828 0.172 
Europe French
(SA001503J) 
58
(9/17/2010) 
N.A0.860 0.140 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(3/8/2016) 
N.A0.793 0.207 
Europe Iberian
(SA004108N) 
214
(5/29/2018) 
N.A0.827 0.173 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(3/8/2016) 
N.A0.864 0.136 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(9/17/2010) 
N.A0.940 0.060 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(9/17/2010) 
N.A0.880 0.120 
Europe Italians
(SA004057Q) 
214
(5/29/2018) 
N.A0.850 0.150 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(3/8/2016) 
N.A0.729 0.271 
Europe Kabardinian
(SA004590S) 
70
(5/29/2018) 
N.A0.871 0.129 
Europe Karachay
(SA004591T) 
46
(5/29/2018) 
N.A0.761 0.239 
Europe Karelians
(SA004617S) 
52
(5/29/2018) 
N.A0.808 0.192 
Europe Megrelians
(SA004623P) 
72
(5/29/2018) 
N.A0.889 0.111 
Europe Moldovan
(SA004598A) 
64
(5/29/2018) 
N.A0.828 0.172 
Europe Mordvin
(SA004599B) 
66
(5/29/2018) 
N.A0.773 0.227 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(9/17/2010) 
N.A0.780 0.220 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.720 0.280 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(3/8/2016) 
N.A0.810 0.191 
Europe Russians
(SA004601L) 
76
(5/29/2018) 
N.A0.855 0.145 
Europe Russians
(SA004603N) 
78
(5/29/2018) 
N.A0.782 0.218 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(9/17/2010) 
N.A0.910 0.090 
Europe Tatar
(SA004604O) 
68
(5/29/2018) 
N.A0.823 0.177 
Europe Udmurt
(SA004607R) 
50
(5/29/2018) 
N.A0.780 0.220 
Europe Ukrainian
(SA004608S) 
58
(5/29/2018) 
N.A0.879 0.121 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.860 0.140 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.920 0.080 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(9/17/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Kazakh
(SA004593V) 
90
(5/29/2018) 
N.A0.811 0.189 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(3/8/2016) 
N.A0.883 0.117 
Asia Khanty
(SA004595X) 
58
(5/29/2018) 
N.A0.879 0.121 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(3/8/2016) 
N.A0.783 0.217 
Asia Komi-Zyrian
(SA004596Y) 
64
(5/29/2018) 
N.A0.781 0.219 
Asia Kyrgyz
(SA004597Z) 
56
(5/29/2018) 
N.A0.857 0.143 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.650 0.350 
Asia Uzbek
(SA004609T) 
78
(5/29/2018) 
N.A0.808 0.192 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.720 0.280 
Asia Bengali
(SA004239S) 
172
(5/29/2018) 
N.A0.762 0.238 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.740 0.260 
Asia Gujarati
(SA004246Q) 
206
(5/29/2018) 
N.A0.733 0.267 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.810 0.190 
Asia Punjabi
(SA004240K) 
192
(5/29/2018) 
N.A0.760 0.240 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.660 0.340 
Asia Tamil
(SA004241L) 
204
(5/29/2018) 
N.A0.691 0.309 
Asia Telugu
(SA004247R) 
204
(5/29/2018) 
N.A0.760 0.240 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(3/8/2016) 
N.A0.908 0.092 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(3/8/2016) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Dai
(SA004238R) 
196
(5/29/2018) 
N.A0.790 0.210 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(9/17/2010) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Han
(SA004058R) 
206
(5/29/2018) 
N.A0.806 0.194 
EastAsia Han
(SA004059S) 
210
(5/29/2018) 
N.A0.819 0.181 
EastAsia Han
(SA004592U) 
26
(5/29/2018) 
N.A0.769 0.231 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(9/17/2010) 
N.A0.860 0.140 
EastAsia Japanese
(SA004060K) 
208
(5/29/2018) 
N.A0.793 0.207 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.824 0.176 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(9/17/2010) 
N.A0.820 0.180 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(3/8/2016) 
N.A0.767 0.233 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(3/8/2016) 
N.A0.770 0.230 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(3/8/2016) 
N.A0.848 0.153 
EastAsia Vietnamese
(SA004249T) 
202
(5/29/2018) 
N.A0.838 0.162 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(9/17/2010) 
N.A1.000 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(9/17/2010) 
N.A0.920 0.080 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(3/8/2016) 
N.A0.939 0.061 
Siberia Buryat
(SA004587Y) 
88
(5/29/2018) 
N.A0.920 0.080 
Asia Ket
(SA004594W) 
62
(5/29/2018) 
N.A0.758 0.242 
Siberia Tuva
(SA004605P) 
88
(5/29/2018) 
N.A0.837 0.163 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.800 0.200 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(3/8/2016) 
N.A0.762 0.238 
Siberia Yakut
(SA004610L) 
82
(5/29/2018) 
N.A0.768 0.232 
NorthAmerica Mexicans
(SA004110G) 
128
(5/29/2018) 
N.A0.859 0.141 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.980 0.020 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.860 0.140 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(3/8/2016) 
N.A0.905 0.095 
NorthAmerica Puerto Rican
(SA004111H) 
208
(5/29/2018) 
N.A0.793 0.207 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(9/17/2010) 
N.A0.920 0.080 
SouthAmerica Colombian
(SA004109O) 
188
(5/29/2018) 
N.A0.787 0.213 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.850 0.150 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(3/8/2016) 
N.A0.800 0.200 
SouthAmerica Peruvian
(SA004245P) 
170
(5/29/2018) 
N.A0.871 0.129 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(3/8/2016) 
N.A0.978 0.022 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(9/17/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(3/8/2016) 
N.A0.957 0.044 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(3/8/2016) 
N.A0.765 0.235 

Total Population Samples 141
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan