ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs313769

Locus Name: Collagen, type XXIV, alpha 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(9/17/2010) 
N.A0.810 0.190 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(9/17/2010) 
N.A0.630 0.380 
Africa San
(SA001469U) 
12
(9/17/2010) 
N.A0.330 0.670 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(9/17/2010) 
N.A0.810 0.190 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(4/14/2016) 
N.A0.714 0.286 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(4/14/2016) 
N.A0.681 0.319 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(9/17/2010) 
N.A0.730 0.270 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(4/14/2016) 
N.A0.605 0.395 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.670 0.330 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(4/14/2016) 
N.A0.756 0.244 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(4/14/2016) 
N.A0.468 0.532 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(4/14/2016) 
N.A0.765 0.235 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(4/14/2016) 
N.A0.500 0.500 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(4/14/2016) 
N.A0.654 0.346 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(4/14/2016) 
N.A0.567 0.433 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.690 0.310 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(9/17/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(9/17/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(9/17/2010) 
N.A0.440 0.560 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(4/14/2016) 
N.A0.500 0.500 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(9/17/2010) 
N.A0.680 0.320 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(4/14/2016) 
N.A0.526 0.474 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(9/17/2010) 
N.A0.470 0.530 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(4/14/2016) 
N.A0.476 0.524 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.690 0.310 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(4/14/2016) 
N.A0.524 0.476 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(4/14/2016) 
N.A0.581 0.419 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(4/14/2016) 
N.A0.560 0.440 
Europe French
(SA001503J) 
58
(9/17/2010) 
N.A0.400 0.600 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(4/14/2016) 
N.A0.610 0.390 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(4/14/2016) 
N.A0.546 0.455 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(9/17/2010) 
N.A0.560 0.440 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(9/17/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(4/14/2016) 
N.A0.667 0.333 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(9/17/2010) 
N.A0.380 0.630 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.640 0.360 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(4/14/2016) 
N.A0.571 0.429 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(9/17/2010) 
N.A0.460 0.540 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.460 0.540 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(9/17/2010) 
N.A0.390 0.610 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(4/14/2016) 
N.A0.415 0.585 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(4/14/2016) 
N.A0.587 0.413 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.350 0.650 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.580 0.420 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.440 0.560 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.360 0.640 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(4/14/2016) 
N.A0.290 0.711 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(4/14/2016) 
N.A0.118 0.882 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(9/17/2010) 
N.A0.420 0.580 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.720 0.280 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(9/17/2010) 
N.A0.410 0.590 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.343 0.657 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.220 0.780 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(9/17/2010) 
N.A0.330 0.670 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(9/17/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(9/17/2010) 
N.A0.140 0.860 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(4/14/2016) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(4/14/2016) 
N.A0.351 0.649 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(4/14/2016) 
N.A0.305 0.695 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(9/17/2010) 
N.A0.410 0.590 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(9/17/2010) 
N.A0.290 0.710 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(4/14/2016) 
N.A0.212 0.788 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.660 0.340 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(4/14/2016) 
N.A0.548 0.452 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.760 0.240 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(9/17/2010) 
N.A0.520 0.480 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(4/14/2016) 
N.A0.548 0.452 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(9/17/2010) 
N.A0.850 0.150 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(9/17/2010) 
N.A0.350 0.650 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(4/14/2016) 
N.A0.120 0.880 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(4/14/2016) 
N.A0.717 0.283 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(9/17/2010) 
N.A0.430 0.570 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(4/14/2016) 
N.A0.413 0.587 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(4/14/2016) 
N.A0.677 0.324 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan