ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs379489

Locus Name: Complement factor H


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.690 0.310 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(6/5/2010) 
N.A0.790 0.210 
Africa San
(SA001469U) 
12
(6/5/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(6/5/2010) 
N.A0.810 0.190 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(6/6/2016) 
N.A0.815 0.185 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(6/6/2016) 
N.A0.778 0.222 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(6/5/2010) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(6/6/2016) 
N.A1.000 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.750 0.250 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(6/6/2016) 
N.A0.641 0.359 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(6/6/2016) 
N.A0.733 0.267 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(6/6/2016) 
N.A0.765 0.235 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(6/6/2016) 
N.A0.788 0.212 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(6/6/2016) 
N.A0.808 0.192 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(6/6/2016) 
N.A0.583 0.417 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.900 0.100 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(6/5/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(6/5/2010) 
N.A0.630 0.380 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(6/5/2010) 
N.A0.650 0.350 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(6/6/2016) 
N.A0.757 0.243 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(6/5/2010) 
N.A0.630 0.370 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(6/6/2016) 
N.A0.645 0.355 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.650 0.350 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(6/6/2016) 
N.A0.595 0.405 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.690 0.310 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(6/6/2016) 
N.A0.634 0.366 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(6/6/2016) 
N.A0.616 0.384 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(6/6/2016) 
N.A0.500 0.500 
Europe French
(SA001503J) 
58
(6/5/2010) 
N.A0.670 0.330 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(6/6/2016) 
N.A0.610 0.390 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(6/6/2016) 
N.A0.477 0.523 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(6/5/2010) 
N.A0.650 0.350 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(6/6/2016) 
N.A0.583 0.417 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(6/5/2010) 
N.A0.310 0.690 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.680 0.320 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(6/6/2016) 
N.A0.643 0.357 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.680 0.320 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.580 0.420 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.460 0.540 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(6/5/2010) 
N.A0.760 0.240 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(6/6/2016) 
N.A0.628 0.372 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(6/6/2016) 
N.A0.598 0.402 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.750 0.250 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.660 0.340 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.740 0.260 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.850 0.150 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(6/6/2016) 
N.A0.987 0.013 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(6/6/2016) 
N.A0.882 0.118 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(6/5/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.930 0.070 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.917 0.083 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.940 0.060 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(6/5/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(6/5/2010) 
N.A0.860 0.140 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(6/6/2016) 
N.A0.900 0.100 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(6/6/2016) 
N.A0.973 0.027 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(6/6/2016) 
N.A0.958 0.042 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.820 0.180 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(6/5/2010) 
N.A0.710 0.290 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(6/6/2016) 
N.A0.833 0.167 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.660 0.340 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(6/6/2016) 
N.A0.738 0.262 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(6/5/2010) 
N.A1.000 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.980 0.020 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(6/6/2016) 
N.A0.976 0.024 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(6/5/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.940 0.060 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(6/6/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(6/6/2016) 
N.A0.783 0.217 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(6/5/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(6/6/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(6/6/2016) 
N.A0.985 0.015 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan