ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs4846930

Locus Name: UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (GalNAc-T2)


Geographic
Region		Population
(Sample UID)		Typed Sample
Size(2N)
(Entry Date)		Add.
info		Genotype
info		Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 		16
(9/25/2010) 		 N.A0.060 0.940 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 		24
(9/25/2010) 		 N.A0.250 0.750 
Africa San
(SA001469U) 		12
(9/25/2010) 		 N.A0.080 0.920 
Africa Afro-Caribbeans
(SA004242M) 		192
(6/1/2018) 		 N.A0.135 0.865 
Africa Biaka
(SA002256P) 		62
(9/25/2010) 		 N.A0.260 0.740 
Africa Esan
(SA004248S) 		198
(6/1/2018) 		 N.A0.066 0.934 
Africa Hausa
(SA004363Q) 		56
(6/10/2016) 		 N.A0.161 0.839 
Africa Ibo
(SA004362P) 		72
(6/10/2016) 		 N.A0.028 0.972 
Africa Malinke
(SA004243N) 		226
(6/1/2018) 		 N.A0.111 0.889 
Africa Mbuti
(SA001466R) 		30
(9/25/2010) 		 N.A0.100 0.900 
Africa Mbuti
(SA004361O) 		38
(6/10/2016) 		 N.A0.132 0.868 
Africa Yoruba
(SA001468T) 		48
(9/25/2010) 		 N.A0.020 0.980 
Africa Yoruba
(SA004048Q) 		216
(6/1/2018) 		 N.A0.065 0.935 
Africa Chagga
(SA004365S) 		78
(6/10/2016) 		 N.A0.115 0.885 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 		62
(6/10/2016) 		 N.A0.129 0.871 
Africa Luhya
(SA004046O) 		198
(6/1/2018) 		 N.A0.126 0.874 
Africa Masai
(SA004364R) 		34
(6/10/2016) 		 N.A0.029 0.971 
Africa Sandawe
(SA004366T) 		66
(6/10/2016) 		 N.A0.121 0.879 
Africa Zaramo
(SA004367U) 		78
(6/10/2016) 		 N.A0.180 0.821 
Africa African Americans
(SA004369W) 		60
(6/10/2016) 		 N.A0.217 0.783 
Africa African Americans
(SA004047P) 		122
(6/1/2018) 		 N.A0.230 0.770 
Africa Mandenka
(SA001467S) 		48
(9/25/2010) 		 N.A0.080 0.920 
Africa Mende
(SA004244O) 		170
(6/1/2018) 		 N.A0.100 0.900 
Africa Mozabite
(SA001471N) 		60
(9/25/2010) 		 N.A0.580 0.420 
Asia Bedouin
(SA002254N) 		94
(9/25/2010) 		 N.A0.400 0.600 
Asia Druze
(SA002257Q) 		94
(9/25/2010) 		 N.A0.520 0.480 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 		74
(6/10/2016) 		 N.A0.608 0.392 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 		102
(9/25/2010) 		 N.A0.560 0.440 
Asia Samaritans
(SA004371P) 		76
(6/10/2016) 		 N.A0.303 0.697 
Europe Abkhaz
(SA004584V) 		52
(6/1/2018) 		 N.A0.577 0.423 
Europe Adygei
(SA001509P) 		34
(9/25/2010) 		 N.A0.850 0.150 
Europe Adygei
(SA004373R) 		42
(6/10/2016) 		 N.A0.619 0.381 
Europe Adygei
(SA004585W) 		62
(6/1/2018) 		 N.A0.661 0.339 
Europe Bashkir
(SA004615Q) 		68
(6/1/2018) 		 N.A0.441 0.559 
Europe Basque
(SA001504K) 		48
(9/25/2010) 		 N.A0.580 0.420 
Europe Belarusian
(SA004586X) 		56
(6/1/2018) 		 N.A0.571 0.429 
Europe British
(SA004050J) 		182
(6/1/2018) 		 N.A0.560 0.440 
Europe Chechen
(SA004589A) 		36
(6/1/2018) 		 N.A0.750 0.250 
Europe Cherkess
(SA004588Z) 		66
(6/1/2018) 		 N.A0.515 0.485 
Europe Chuvash
(SA004374S) 		82
(6/10/2016) 		 N.A0.524 0.476 
Europe Chuvash
(SA004600K) 		56
(6/1/2018) 		 N.A0.464 0.536 
Europe Danes
(SA004392S) 		86
(6/10/2016) 		 N.A0.500 0.500 
Europe Estonian
(SA003028N) 		1948
(11/18/2009) 		 N.A0.579 0.421 
Europe European Americans
(SA004250L) 		198
(6/1/2018) 		 N.A0.621 0.379 
Europe Finns
(SA004377V) 		50
(6/10/2016) 		 N.A0.540 0.460 
Europe Finns
(SA004049R) 		198
(6/1/2018) 		 N.A0.606 0.394 
Europe French
(SA001503J) 		58
(9/25/2010) 		 N.A0.530 0.470 
Europe Hungarian
(SA004375T) 		82
(6/10/2016) 		 N.A0.695 0.305 
Europe Iberian
(SA004108N) 		214
(6/1/2018) 		 N.A0.603 0.397 
Europe Irish
(SA004378W) 		44
(6/10/2016) 		 N.A0.614 0.386 
Europe Italians
(SA001507N) 		16
(9/25/2010) 		 N.A0.630 0.380 
Europe Italians
(SA002255O) 		26
(9/25/2010) 		 N.A0.580 0.420 
Europe Italians
(SA004057Q) 		214
(6/1/2018) 		 N.A0.565 0.435 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 		48
(6/10/2016) 		 N.A0.583 0.417 
Europe Kabardinian
(SA004590S) 		70
(6/1/2018) 		 N.A0.571 0.429 
Europe Karachay
(SA004591T) 		46
(6/1/2018) 		 N.A0.565 0.435 
Europe Karelians
(SA004617S) 		52
(6/1/2018) 		 N.A0.654 0.346 
Europe Megrelians
(SA004623P) 		72
(6/1/2018) 		 N.A0.556 0.444 
Europe Moldovan
(SA004598A) 		64
(6/1/2018) 		 N.A0.453 0.547 
Europe Mordvin
(SA004599B) 		66
(6/1/2018) 		 N.A0.561 0.439 
Europe Orcadian
(SA001508O) 		32
(9/25/2010) 		 N.A0.440 0.560 
Europe Russians
(SA001510H) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.520 0.480 
Europe Russians
(SA004376U) 		42
(6/10/2016) 		 N.A0.500 0.500 
Europe Russians
(SA004601L) 		76
(6/1/2018) 		 N.A0.461 0.539 
Europe Russians
(SA004603N) 		78
(6/1/2018) 		 N.A0.680 0.320 
Europe Sardinian
(SA001505L) 		56
(9/25/2010) 		 N.A0.500 0.500 
Europe Tatar
(SA004604O) 		68
(6/1/2018) 		 N.A0.456 0.544 
Europe Udmurt
(SA004607R) 		50
(6/1/2018) 		 N.A0.460 0.540 
Europe Ukrainian
(SA004608S) 		58
(6/1/2018) 		 N.A0.586 0.414 
Asia Burusho
(SA001482P) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.640 0.360 
Asia Kalash
(SA001481O) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.700 0.300 
Asia Pashtun
(SA002262M) 		46
(9/25/2010) 		 N.A0.570 0.430 
Asia Kazakh
(SA004593V) 		90
(6/1/2018) 		 N.A0.267 0.733 
Asia Khanty
(SA004380P) 		94
(6/10/2016) 		 N.A0.330 0.670 
Asia Khanty
(SA004595X) 		58
(6/1/2018) 		 N.A0.431 0.569 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 		92
(6/10/2016) 		 N.A0.435 0.565 
Asia Komi-Zyrian
(SA004596Y) 		64
(6/1/2018) 		 N.A0.438 0.562 
Asia Kyrgyz
(SA004597Z) 		56
(6/1/2018) 		 N.A0.393 0.607 
Asia Mongolian
(SA001489W) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.100 0.900 
Asia Uzbek
(SA004609T) 		78
(6/1/2018) 		 N.A0.385 0.615 
Asia Balochi
(SA001476S) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.840 0.160 
Asia Balochi
(SA001478U) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.600 0.400 
Asia Bengali
(SA004239S) 		172
(6/1/2018) 		 N.A0.424 0.576 
Asia Brahui
(SA001475R) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.640 0.360 
Asia Gujarati
(SA004246Q) 		206
(6/1/2018) 		 N.A0.573 0.427 
Asia Hazara
(SA001477T) 		48
(9/25/2010) 		 N.A0.420 0.580 
Asia Punjabi
(SA004240K) 		192
(6/1/2018) 		 N.A0.438 0.562 
Asia Sindhi
(SA001479V) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.360 0.640 
Asia Tamil
(SA004241L) 		204
(6/1/2018) 		 N.A0.583 0.417 
Asia Telugu
(SA004247R) 		204
(6/1/2018) 		 N.A0.549 0.451 
EastAsia Ami
(SA004386V) 		76
(6/10/2016) 		 N.A0.197 0.803 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 		68
(6/10/2016) 		 N.A0.250 0.750 
EastAsia Dai
(SA001493R) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.150 0.850 
EastAsia Dai
(SA004238R) 		196
(6/1/2018) 		 N.A0.124 0.876 
EastAsia Daur
(SA001488V) 		18
(9/25/2010) 		 N.A0 1.000 
EastAsia Han
(SA001483Q) 		88
(9/25/2010) 		 N.A0.090 0.910 
EastAsia Han
(SA004058R) 		206
(6/1/2018) 		 N.A0.063 0.937 
EastAsia Han
(SA004059S) 		210
(6/1/2018) 		 N.A0.105 0.895 
EastAsia Han
(SA004592U) 		26
(6/1/2018) 		 N.A0.115 0.885 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 		18
(9/25/2010) 		 N.A0.060 0.940 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 		56
(9/25/2010) 		 N.A0.040 0.960 
EastAsia Japanese
(SA004060K) 		208
(6/1/2018) 		 N.A0.101 0.899 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 		106
(10/6/2009) 		 N.A0.111 0.889 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.150 0.850 
EastAsia Miao
(SA001486T) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.200 0.800 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 		18
(9/25/2010) 		 N.A0.060 0.940 
Asia Oroqen
(SA001487U) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.100 0.900 
EastAsia She
(SA001495T) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.200 0.800 
EastAsia Tu
(SA001497V) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.100 0.900 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.200 0.800 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.400 0.600 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 		18
(9/25/2010) 		 N.A0.110 0.890 
EastAsia Yi
(SA001485S) 		20
(9/25/2010) 		 N.A0.050 0.950 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 		22
(9/25/2010) 		 N.A0 1.000 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 		30
(6/10/2016) 		 N.A0.200 0.800 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 		74
(6/10/2016) 		 N.A0.081 0.919 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 		118
(6/10/2016) 		 N.A0.195 0.805 
EastAsia Vietnamese
(SA004249T) 		202
(6/1/2018) 		 N.A0.116 0.884 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 		34
(9/25/2010) 		 N.A0.210 0.790 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 		38
(9/25/2010) 		 N.A0.530 0.470 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 		66
(6/10/2016) 		 N.A0.227 0.773 
Siberia Buryat
(SA004587Y) 		88
(6/1/2018) 		 N.A0.261 0.739 
Asia Ket
(SA004594W) 		62
(6/1/2018) 		 N.A0.290 0.710 
Siberia Tuva
(SA004605P) 		88
(6/1/2018) 		 N.A0.193 0.807 
Siberia Yakut
(SA001498W) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.180 0.820 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 		42
(6/10/2016) 		 N.A0.143 0.857 
Siberia Yakut
(SA004610L) 		82
(6/1/2018) 		 N.A0.146 0.854 
NorthAmerica Mexicans
(SA004110G) 		128
(6/1/2018) 		 N.A0.305 0.695 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.280 0.720 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 		50
(9/25/2010) 		 N.A0.220 0.780 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 		42
(6/10/2016) 		 N.A0.024 0.976 
NorthAmerica Puerto Rican
(SA004111H) 		208
(6/1/2018) 		 N.A0.389 0.611 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 		26
(9/25/2010) 		 N.A0.120 0.880 
SouthAmerica Colombian
(SA004109O) 		188
(6/1/2018) 		 N.A0.404 0.596 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 		48
(9/25/2010) 		 N.A0.060 0.940 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 		50
(6/10/2016) 		 N.A0.100 0.900 
SouthAmerica Peruvian
(SA004245P) 		170
(6/1/2018) 		 N.A0.141 0.859 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 		46
(6/10/2016) 		 N.A0.087 0.913 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 		42
(9/25/2010) 		 N.A0 1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 		46
(6/10/2016) 		 N.A0 1.000 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 		68
(6/10/2016) 		 N.A0.265 0.735 

Total Population Samples 141
Total Alleles: 2

© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan