ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs4908440

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(9/25/2010) 
N.A0.250 0.750 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(9/25/2010) 
N.A0.170 0.830 
Africa San
(SA001469U) 
12
(9/25/2010) 
N.A0.420 0.580 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(9/25/2010) 
N.A0.320 0.680 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.232 0.768 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.181 0.819 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(9/25/2010) 
N.A0.170 0.830 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.237 0.763 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(9/25/2010) 
N.A0.330 0.670 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.256 0.744 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.403 0.597 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.118 0.882 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.273 0.727 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.141 0.859 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.300 0.700 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(9/25/2010) 
N.A0.150 0.850 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(9/25/2010) 
N.A0.450 0.550 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(9/25/2010) 
N.A0.350 0.650 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(9/25/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.419 0.581 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(9/25/2010) 
N.A0.460 0.540 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.737 0.263 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(9/25/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.476 0.524 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(9/25/2010) 
N.A0.400 0.600 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.317 0.683 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.419 0.581 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1944
(11/18/2009) 
N.A0.371 0.629 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.360 0.640 
Europe French
(SA001503J) 
58
(9/25/2010) 
N.A0.470 0.530 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.378 0.622 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.386 0.614 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(9/25/2010) 
N.A0.440 0.560 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(9/25/2010) 
N.A0.310 0.690 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.542 0.458 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(9/25/2010) 
N.A0.470 0.530 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.340 0.660 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.286 0.714 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(9/25/2010) 
N.A0.430 0.570 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.460 0.540 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(9/25/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.309 0.692 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.391 0.609 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.150 0.850 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.640 0.360 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(9/25/2010) 
N.A0.380 0.630 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.440 0.560 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.276 0.724 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.103 0.897 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(9/25/2010) 
N.A0.280 0.720 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(9/25/2010) 
N.A0.160 0.840 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(9/25/2010) 
N.A0.170 0.830 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(9/25/2010) 
N.A0.130 0.880 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.085 0.915 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(9/25/2010) 
N.A1.000 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.300 0.700 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(9/25/2010) 
N.A0.170 0.830 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(9/25/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(9/25/2010) 
N.A0.180 0.820 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.203 0.797 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.161 0.839 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(9/25/2010) 
N.A0.350 0.650 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(9/25/2010) 
N.A0.290 0.710 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.030 0.970 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.240 0.760 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.214 0.786 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.520 0.480 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(9/25/2010) 
N.A0.120 0.880 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.048 0.952 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(9/25/2010) 
N.A0.270 0.730 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(9/25/2010) 
N.A0.060 0.940 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.060 0.940 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.435 0.565 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(9/25/2010) 
N.A0.070 0.930 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.065 0.935 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.309 0.691 

Total Population Samples 87
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan