ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs623974

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(10/8/2010) 
N.A0.960 0.040 
Africa San
(SA001469U) 
12
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A1.000 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.983 0.017 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(10/8/2010) 
N.A0.970 0.030 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(10/8/2010) 
N.A0.970 0.030 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(10/8/2010) 
N.A0.890 0.110 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.946 0.054 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(10/8/2010) 
N.A0.930 0.070 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.974 0.026 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(10/8/2010) 
N.A0.940 0.060 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.976 0.024 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.850 0.150 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.878 0.122 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.861 0.140 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.900 0.100 
Europe French
(SA001503J) 
58
(10/8/2010) 
N.A0.790 0.210 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.854 0.146 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.909 0.091 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(10/8/2010) 
N.A0.960 0.040 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.771 0.229 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(10/8/2010) 
N.A0.840 0.160 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.900 0.100 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.881 0.119 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(10/8/2010) 
N.A0.910 0.090 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.980 0.020 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(10/8/2010) 
N.A0.870 0.130 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.819 0.181 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.696 0.304 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.840 0.160 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.900 0.100 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.880 0.120 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.960 0.040 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.920 0.080 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.987 0.013 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A1.000 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.940 0.060 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(10/8/2010) 
N.A0.980 0.020 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.890 0.110 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(10/8/2010) 
N.A0.980 0.020 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/6/2009) 
N.A0.944 0.056 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(10/8/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(10/8/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(10/8/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(10/8/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.950 0.050 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(10/8/2010) 
N.A0.860 0.140 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.967 0.033 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.919 0.081 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.992 0.009 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(10/8/2010) 
N.A0.840 0.160 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.955 0.046 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.820 0.180 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.833 0.167 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(10/8/2010) 
N.A1.000 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.940 0.060 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.881 0.119 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(10/8/2010) 
N.A0.690 0.310 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.520 0.480 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.720 0.280 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.913 0.087 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(10/8/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.957 0.044 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.779 0.221 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan