ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs6662782

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(10/8/2010) 
N.A0.940 0.060 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(10/8/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa San
(SA001469U) 
12
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(10/8/2010) 
N.A0.970 0.030 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.911 0.089 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.931 0.069 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.974 0.026 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.910 0.090 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.710 0.290 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.824 0.177 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.803 0.197 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.962 0.039 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.883 0.117 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.960 0.040 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(10/8/2010) 
N.A0.770 0.230 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(10/8/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(10/8/2010) 
N.A0.680 0.320 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.716 0.284 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(10/8/2010) 
N.A0.620 0.380 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.895 0.105 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(10/8/2010) 
N.A0.850 0.150 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.786 0.214 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.350 0.650 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.610 0.390 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.616 0.384 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.640 0.360 
Europe French
(SA001503J) 
58
(10/8/2010) 
N.A0.660 0.340 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.671 0.329 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.614 0.386 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(10/8/2010) 
N.A0.630 0.380 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.646 0.354 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(10/8/2010) 
N.A0.470 0.530 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.540 0.460 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.691 0.310 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(10/8/2010) 
N.A0.630 0.380 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(10/8/2010) 
N.A0.780 0.220 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.596 0.404 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.587 0.413 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.620 0.380 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.880 0.120 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.640 0.360 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.790 0.210 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.780 0.220 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.934 0.066 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.779 0.221 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.780 0.220 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(10/8/2010) 
N.A0.720 0.280 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(10/8/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/7/2009) 
N.A0.648 0.352 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.610 0.390 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.850 0.150 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.670 0.330 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(10/8/2010) 
N.A0.680 0.320 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.767 0.233 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.622 0.378 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.822 0.178 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(10/8/2010) 
N.A0.320 0.680 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(10/8/2010) 
N.A0.610 0.390 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.803 0.197 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.680 0.320 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.786 0.214 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.600 0.400 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.580 0.420 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.452 0.548 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(10/8/2010) 
N.A0.880 0.120 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.380 0.630 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.140 0.860 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.544 0.457 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(10/8/2010) 
N.A0.140 0.860 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.239 0.761 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.574 0.427 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan