ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs6686587

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
AG
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(10/8/2010) 
N.A0.440 0.560 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(10/8/2010) 
N.A0.460 0.540 
Africa San
(SA001469U) 
12
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(10/8/2010) 
N.A0.400 0.600 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.375 0.625 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.278 0.722 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(10/8/2010) 
N.A0.600 0.400 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.342 0.658 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.487 0.513 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.450 0.550 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.441 0.559 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.422 0.578 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.590 0.410 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.586 0.414 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.580 0.420 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(10/8/2010) 
N.A0.370 0.630 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(10/8/2010) 
N.A0.430 0.570 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(10/8/2010) 
N.A0.460 0.540 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.392 0.608 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(10/8/2010) 
N.A0.530 0.470 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.263 0.737 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(10/8/2010) 
N.A0.410 0.590 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.452 0.548 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.380 0.630 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.561 0.439 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.512 0.488 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1938
(11/18/2009) 
N.A0.534 0.466 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.620 0.380 
Europe French
(SA001503J) 
58
(10/8/2010) 
N.A0.530 0.470 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.450 0.550 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.364 0.636 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(10/8/2010) 
N.A0.440 0.560 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(10/8/2010) 
N.A0.540 0.460 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.542 0.458 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.520 0.480 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.571 0.429 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
54
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.820 0.180 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(10/8/2010) 
N.A0.670 0.330 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.489 0.511 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.567 0.433 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.550 0.450 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.480 0.520 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.540 0.460 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.421 0.579 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.530 0.470 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.280 0.720 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(10/8/2010) 
N.A0.320 0.680 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.330 0.670 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(10/8/2010) 
N.A0.480 0.520 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/7/2009) 
N.A0.398 0.602 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.330 0.670 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.250 0.750 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.400 0.600 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.350 0.650 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.330 0.670 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(10/8/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.324 0.676 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.314 0.686 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(10/8/2010) 
N.A0.710 0.290 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(10/8/2010) 
N.A0.680 0.320 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.469 0.531 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.280 0.720 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.405 0.595 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.220 0.780 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.460 0.540 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.452 0.548 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(10/8/2010) 
N.A0.620 0.380 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.710 0.290 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.500 0.500 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.348 0.652 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(10/8/2010) 
N.A0.430 0.570 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.348 0.652 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.515 0.485 

Total Population Samples 87
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan