ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs6691275

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(10/8/2010) 
N.A0.380 0.630 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(10/8/2010) 
N.A0.250 0.750 
Africa San
(SA001469U) 
12
(10/8/2010) 
N.A0.580 0.420 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(10/8/2010) 
N.A0.480 0.520 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.321 0.679 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.333 0.667 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(10/8/2010) 
N.A0.600 0.400 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.526 0.474 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.230 0.770 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.372 0.628 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.129 0.871 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.324 0.677 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.546 0.455 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.423 0.577 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.367 0.633 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.290 0.710 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(10/8/2010) 
N.A0.130 0.870 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(10/8/2010) 
N.A0.090 0.910 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(10/8/2010) 
N.A0.130 0.870 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.041 0.960 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(10/8/2010) 
N.A0.130 0.870 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.197 0.803 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(10/8/2010) 
N.A0.150 0.850 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.310 0.691 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.040 0.960 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.183 0.817 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.116 0.884 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.120 0.880 
Europe French
(SA001503J) 
58
(10/8/2010) 
N.A0.140 0.860 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.110 0.890 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.159 0.841 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(10/8/2010) 
N.A0.150 0.850 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.063 0.938 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(10/8/2010) 
N.A0.130 0.880 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.140 0.860 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.048 0.952 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(10/8/2010) 
N.A0.110 0.890 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.180 0.820 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.060 0.940 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(10/8/2010) 
N.A0.170 0.830 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.234 0.766 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.152 0.848 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.180 0.820 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.120 0.880 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.060 0.940 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.080 0.920 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.013 0.987 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.015 0.985 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.170 0.830 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(10/8/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.280 0.720 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(10/8/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/7/2009) 
N.A0.120 0.880 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.050 0.950 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.110 0.890 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.200 0.800 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(10/8/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.100 0.900 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(10/8/2010) 
N.A0.110 0.890 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(10/8/2010) 
N.A0.150 0.850 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(10/8/2010) 
N.A1.000 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.067 0.933 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.081 0.919 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.042 0.958 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(10/8/2010) 
N.A1.000 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(10/8/2010) 
N.A0.130 0.870 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.091 0.909 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.340 0.660 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.310 0.691 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.180 0.820 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(10/8/2010) 
N.A0.120 0.880 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.071 0.929 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(10/8/2010) 
N.A0.230 0.770 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(10/8/2010) 
N.A0.020 0.980 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A1.000 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.044 0.957 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(10/8/2010) 
N.A1.000 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.087 0.913 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.324 0.677 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan