ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs7544004

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
GT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.630 0.380 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(6/5/2010) 
N.A0.580 0.420 
Africa San
(SA001469U) 
12
(6/5/2010) 
N.A0.250 0.750 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(6/5/2010) 
N.A0.530 0.470 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.411 0.589 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.486 0.514 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(6/5/2010) 
N.A0.300 0.700 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.316 0.684 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.460 0.540 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.321 0.680 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.355 0.645 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.412 0.588 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.318 0.682 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.321 0.680 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.617 0.383 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.380 0.630 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(6/5/2010) 
N.A0.520 0.480 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(6/5/2010) 
N.A0.340 0.660 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(6/5/2010) 
N.A0.490 0.510 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.514 0.487 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(6/5/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.842 0.158 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.620 0.380 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.571 0.429 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.770 0.230 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.707 0.293 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.651 0.349 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.640 0.360 
Europe French
(SA001503J) 
58
(6/5/2010) 
N.A0.600 0.400 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.549 0.451 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.546 0.455 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(6/5/2010) 
N.A0.810 0.190 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(6/5/2010) 
N.A0.650 0.350 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.583 0.417 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(6/5/2010) 
N.A0.630 0.380 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.700 0.300 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.619 0.381 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.680 0.320 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.580 0.420 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.585 0.415 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.728 0.272 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.600 0.400 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.620 0.380 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.460 0.540 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.670 0.330 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.440 0.560 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.540 0.461 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.471 0.529 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.650 0.350 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(6/5/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(6/5/2010) 
N.A0.520 0.480 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/7/2009) 
N.A0.472 0.528 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.720 0.280 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.700 0.300 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(6/5/2010) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(6/5/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(6/5/2010) 
N.A0.680 0.320 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.433 0.567 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.595 0.405 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.610 0.390 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(6/5/2010) 
N.A0.740 0.260 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(6/5/2010) 
N.A0.550 0.450 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.576 0.424 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.860 0.140 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.762 0.238 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.800 0.200 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(6/5/2010) 
N.A0.500 0.500 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.643 0.357 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(6/5/2010) 
N.A0.880 0.120 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(6/5/2010) 
N.A0.650 0.350 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.700 0.300 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.630 0.370 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(6/5/2010) 
N.A0.570 0.430 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.630 0.370 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.471 0.529 

Total Population Samples 86
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan