ALFRED allele frequency in tabular format
      The ALlele FREquency Database   
ALFRED is a resource of gene frequency data on human populations
supported by the Yale Center for Medical Informatics.

Allele Frequency For Polymorphic Site: rs7549870

Locus Name: Calmodulin binding transcription activator 1


Geographic
Region
Population
(Sample UID)
Typed Sample
Size
(2N)
(Entry Date)
Add.
info
Genotype
info
Allele Symbol
CT
Africa Bantu speakers
(SA001818S) 
16
(11/4/2010) 
N.A0.880 0.130 
Africa Bantu speakers
(SA001819T) 
24
(11/4/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa San
(SA001469U) 
12
(11/4/2010) 
N.A0.580 0.420 
Africa Afro-Caribbeans
(SA004242M) 
192
(5/23/2018) 
N.A0.885 0.115 
Africa Biaka
(SA002256P) 
62
(11/4/2010) 
N.A0.950 0.050 
Africa Esan
(SA004248S) 
198
(5/23/2018) 
N.A0.899 0.101 
Africa Hausa
(SA003960S) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.740 0.260 
Africa Hausa
(SA004363Q) 
56
(2/17/2016) 
N.A0.750 0.250 
Africa Ibo
(SA004362P) 
72
(2/17/2016) 
N.A0.847 0.153 
Africa Malinke
(SA004243N) 
226
(5/23/2018) 
N.A0.929 0.071 
Africa Mbuti
(SA001466R) 
30
(11/4/2010) 
N.A0.900 0.100 
Africa Mbuti
(SA004361O) 
38
(2/17/2016) 
N.A0.921 0.079 
Africa Yoruba
(SA001468T) 
48
(11/4/2010) 
N.A0.810 0.190 
Africa Yoruba
(SA004048Q) 
216
(5/23/2018) 
N.A0.870 0.130 
Africa Chagga
(SA004365S) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.821 0.180 
Africa Jews, Ethiopian
(SA003973W) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.870 0.130 
Africa Jews, Ethiopian
(SA004368V) 
62
(2/17/2016) 
N.A0.758 0.242 
Africa Luhya
(SA004046O) 
198
(5/23/2018) 
N.A0.808 0.192 
Africa Masai
(SA004364R) 
34
(2/17/2016) 
N.A0.941 0.059 
Africa Sandawe
(SA004366T) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.591 0.409 
Africa Zaramo
(SA004367U) 
78
(2/17/2016) 
N.A0.885 0.115 
Africa African Americans
(SA003982W) 
118
(2/27/2012) 
N.A0.920 0.080 
Africa African Americans
(SA004369W) 
60
(2/17/2016) 
N.A0.867 0.133 
Africa African Americans
(SA004047P) 
122
(5/23/2018) 
N.A0.828 0.172 
Africa Mandenka
(SA001467S) 
48
(11/4/2010) 
N.A0.920 0.080 
Africa Mende
(SA004244O) 
170
(5/23/2018) 
N.A0.865 0.135 
Africa Mozabite
(SA001471N) 
60
(11/4/2010) 
N.A0.630 0.370 
Asia Bedouin
(SA002254N) 
96
(11/4/2010) 
N.A0.490 0.510 
Asia Druze
(SA002257Q) 
94
(11/4/2010) 
N.A0.610 0.390 
Asia Druze
(SA003961T) 
54
(2/27/2012) 
N.A0.780 0.220 
Asia Jews, Yemenite
(SA003959A) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.620 0.380 
Asia Jews, Yemenite
(SA004370O) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.676 0.324 
Asia Palestinian
(SA001474Q) 
102
(11/4/2010) 
N.A0.750 0.250 
Asia Samaritans
(SA004371P) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.908 0.092 
Europe Abkhaz
(SA004584V) 
52
(5/23/2018) 
N.A0.673 0.327 
Europe Adygei
(SA001509P) 
34
(11/4/2010) 
N.A0.760 0.240 
Europe Adygei
(SA003974X) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.680 0.320 
Europe Adygei
(SA004373R) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.619 0.381 
Europe Adygei
(SA004585W) 
62
(5/23/2018) 
N.A0.710 0.290 
Europe Bashkir
(SA004615Q) 
68
(5/23/2018) 
N.A0.765 0.235 
Europe Basque
(SA001504K) 
48
(11/4/2010) 
N.A0.850 0.150 
Europe Belarusian
(SA004586X) 
56
(5/23/2018) 
N.A0.661 0.339 
Europe British
(SA004050J) 
182
(5/23/2018) 
N.A0.736 0.264 
Europe Chechen
(SA004589A) 
36
(5/23/2018) 
N.A0.556 0.444 
Europe Cherkess
(SA004588Z) 
66
(5/23/2018) 
N.A0.788 0.212 
Europe Chuvash
(SA003969B) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.800 0.200 
Europe Chuvash
(SA004374S) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.768 0.232 
Europe Chuvash
(SA004600K) 
56
(5/23/2018) 
N.A0.786 0.214 
Europe Danes
(SA004392S) 
86
(2/17/2016) 
N.A0.756 0.244 
Europe Estonian
(SA003028N) 
1952
(11/18/2009) 
N.A0.727 0.273 
Europe European Americans
(SA003983X) 
96
(2/27/2012) 
N.A0.650 0.350 
Europe European Americans
(SA004250L) 
198
(5/23/2018) 
N.A0.707 0.293 
Europe Finns
(SA004377V) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.880 0.120 
Europe Finns
(SA004049R) 
198
(5/23/2018) 
N.A0.752 0.248 
Europe French
(SA001503J) 
58
(11/4/2010) 
N.A0.740 0.260 
Europe Hungarian
(SA003976Z) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.700 0.300 
Europe Hungarian
(SA004375T) 
82
(2/17/2016) 
N.A0.720 0.281 
Europe Iberian
(SA004108N) 
214
(5/23/2018) 
N.A0.710 0.290 
Europe Irish
(SA003979C) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.670 0.330 
Europe Irish
(SA004378W) 
44
(2/17/2016) 
N.A0.659 0.341 
Europe Italians
(SA001507N) 
16
(11/4/2010) 
N.A0.690 0.310 
Europe Italians
(SA002255O) 
26
(11/4/2010) 
N.A0.690 0.310 
Europe Italians
(SA004057Q) 
214
(5/23/2018) 
N.A0.762 0.238 
Europe Jews, Ashkenazi
(SA004372Q) 
48
(2/17/2016) 
N.A0.750 0.250 
Europe Kabardinian
(SA004590S) 
70
(5/23/2018) 
N.A0.714 0.286 
Europe Karachay
(SA004591T) 
46
(5/23/2018) 
N.A0.841 0.159 
Europe Karelians
(SA004617S) 
52
(5/23/2018) 
N.A0.788 0.212 
Europe Megrelians
(SA004623P) 
72
(5/23/2018) 
N.A0.736 0.264 
Europe Moldovan
(SA004598A) 
64
(5/23/2018) 
N.A0.797 0.203 
Europe Mordvin
(SA004599B) 
66
(5/23/2018) 
N.A0.697 0.303 
Europe Orcadian
(SA001508O) 
32
(11/4/2010) 
N.A0.690 0.310 
Europe Russians
(SA001510H) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.700 0.300 
Europe Russians
(SA004376U) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.786 0.214 
Europe Russians
(SA004601L) 
76
(5/23/2018) 
N.A0.763 0.237 
Europe Russians
(SA004603N) 
78
(5/23/2018) 
N.A0.679 0.321 
Europe Sardinian
(SA001505L) 
56
(11/4/2010) 
N.A0.800 0.200 
Europe Tatar
(SA004604O) 
68
(5/23/2018) 
N.A0.691 0.309 
Europe Udmurt
(SA004607R) 
50
(5/23/2018) 
N.A0.680 0.320 
Europe Ukrainian
(SA004608S) 
58
(5/23/2018) 
N.A0.638 0.362 
Asia Burusho
(SA001482P) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.660 0.340 
Asia Kalash
(SA001481O) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.560 0.440 
Asia Pashtun
(SA002262M) 
46
(11/4/2010) 
N.A0.630 0.370 
Asia Kazakh
(SA004593V) 
90
(5/23/2018) 
N.A0.756 0.244 
Asia Khanty
(SA003968A) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.700 0.300 
Asia Khanty
(SA004380P) 
94
(2/17/2016) 
N.A0.670 0.330 
Asia Khanty
(SA004595X) 
58
(5/23/2018) 
N.A0.724 0.276 
Asia Komi-Zyrian
(SA003962U) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.870 0.130 
Asia Komi-Zyrian
(SA004379X) 
92
(2/17/2016) 
N.A0.826 0.174 
Asia Komi-Zyrian
(SA004596Y) 
64
(5/23/2018) 
N.A0.609 0.391 
Asia Kyrgyz
(SA004597Z) 
56
(5/23/2018) 
N.A0.804 0.196 
Asia Mongolian
(SA001489W) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.550 0.450 
Asia Uzbek
(SA004609T) 
78
(5/23/2018) 
N.A0.641 0.359 
Asia Balochi
(SA001476S) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.680 0.320 
Asia Balochi
(SA001478U) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.720 0.280 
Asia Bengali
(SA004239S) 
172
(5/23/2018) 
N.A0.709 0.291 
Asia Brahui
(SA001475R) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.700 0.300 
Asia Gujarati
(SA004246Q) 
206
(5/23/2018) 
N.A0.709 0.291 
Asia Hazara
(SA001477T) 
48
(11/4/2010) 
N.A0.650 0.350 
Asia Keralite
(SA003963V) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.660 0.340 
Asia Punjabi
(SA004240K) 
192
(5/23/2018) 
N.A0.734 0.266 
Asia Sindhi
(SA001479V) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.680 0.320 
Asia Tamil
(SA004241L) 
204
(5/23/2018) 
N.A0.608 0.392 
Asia Telugu
(SA004247R) 
204
(5/23/2018) 
N.A0.672 0.328 
EastAsia Ami
(SA003975Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Ami
(SA004386V) 
76
(2/17/2016) 
N.A0.526 0.474 
EastAsia Atayal
(SA003971U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.520 0.480 
EastAsia Atayal
(SA004387W) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.559 0.441 
EastAsia Dai
(SA001493R) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Dai
(SA004238R) 
196
(5/23/2018) 
N.A0.613 0.387 
EastAsia Daur
(SA001488V) 
18
(11/4/2010) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Han
(SA001483Q) 
88
(11/4/2010) 
N.A0.510 0.490 
EastAsia Han
(SA004058R) 
206
(5/23/2018) 
N.A0.612 0.388 
EastAsia Han
(SA004059S) 
210
(5/23/2018) 
N.A0.567 0.433 
EastAsia Han
(SA004592U) 
26
(5/23/2018) 
N.A0.731 0.269 
EastAsia Hezhe
(SA001490O) 
18
(11/4/2010) 
N.A0.830 0.170 
EastAsia Japanese
(SA002260K) 
56
(11/4/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Japanese
(SA003972V) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.560 0.440 
EastAsia Japanese
(SA004060K) 
208
(5/23/2018) 
N.A0.611 0.389 
EastAsia Koreans
(SA003027M) 
106
(10/7/2009) 
N.A0.500 0.500 
EastAsia Koreans
(SA003958Z) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.460 0.540 
EastAsia Lahu
(SA001494S) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.800 0.200 
EastAsia Miao
(SA001486T) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.450 0.550 
EastAsia Naxi
(SA001496U) 
18
(11/4/2010) 
N.A0.720 0.280 
Asia Oroqen
(SA001487U) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia She
(SA001495T) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Tu
(SA001497V) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Tujia
(SA001484R) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.750 0.250 
EastAsia Uyghur
(SA001492Q) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.550 0.450 
EastAsia Xibe
(SA001491P) 
18
(11/4/2010) 
N.A0.610 0.390 
EastAsia Yi
(SA001485S) 
20
(11/4/2010) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA001500G) 
22
(11/4/2010) 
N.A0.680 0.320 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA003967Z) 
36
(2/27/2012) 
N.A0.530 0.470 
EastAsia Cambodians, Khmer
(SA004384T) 
30
(2/17/2016) 
N.A0.433 0.567 
EastAsia Hakka
(SA003978B) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.600 0.400 
EastAsia Hakka
(SA004385U) 
74
(2/17/2016) 
N.A0.568 0.432 
Asia Lao Loum
(SA003980U) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.580 0.420 
Asia Lao Loum
(SA004383S) 
118
(2/17/2016) 
N.A0.636 0.364 
EastAsia Vietnamese
(SA004249T) 
202
(5/23/2018) 
N.A0.626 0.374 
Oceania Gimi
(SA003981V) 
30
(2/27/2012) 
N.A1.000 
Oceania Papuan New Guinean
(SA001501H) 
34
(11/4/2010) 
N.A1.000 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA002261L) 
38
(11/4/2010) 
N.A0.890 0.110 
Oceania Melanesian, Nasioi
(SA003966Y) 
34
(2/27/2012) 
N.A0.850 0.150 
Oceania Micronesians
(SA003977A) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.620 0.380 
Oceania Micronesians
(SA004382R) 
66
(2/17/2016) 
N.A0.652 0.349 
Siberia Buryat
(SA004587Y) 
88
(5/23/2018) 
N.A0.807 0.193 
Asia Ket
(SA004594W) 
62
(5/23/2018) 
N.A0.823 0.177 
Siberia Tuva
(SA004605P) 
88
(5/23/2018) 
N.A0.841 0.159 
Siberia Yakut
(SA001498W) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.860 0.140 
Siberia Yakut
(SA003970T) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.850 0.150 
Siberia Yakut
(SA004381Q) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.833 0.167 
Siberia Yakut
(SA004610L) 
82
(5/23/2018) 
N.A0.890 0.110 
NorthAmerica Mexicans
(SA004110G) 
128
(5/23/2018) 
N.A0.680 0.320 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA001511I) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.800 0.200 
NorthAmerica Pima, Mexico
(SA003955W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.820 0.180 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA001512J) 
50
(11/4/2010) 
N.A0.560 0.440 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA003964W) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.680 0.320 
NorthAmerica Maya, Yucatan
(SA004388X) 
42
(2/17/2016) 
N.A0.738 0.262 
NorthAmerica Puerto Rican
(SA004111H) 
208
(5/23/2018) 
N.A0.745 0.255 
SouthAmerica Amerindians
(SA001513K) 
26
(11/4/2010) 
N.A0.880 0.120 
SouthAmerica Colombian
(SA004109O) 
188
(5/23/2018) 
N.A0.644 0.356 
SouthAmerica Karitiana
(SA001514L) 
48
(11/4/2010) 
N.A0.650 0.350 
SouthAmerica Karitiana
(SA003957Y) 
48
(2/27/2012) 
N.A0.690 0.310 
SouthAmerica Karitiana
(SA004391R) 
50
(2/17/2016) 
N.A0.700 0.300 
SouthAmerica Peruvian
(SA004245P) 
170
(5/23/2018) 
N.A0.576 0.424 
SouthAmerica Quechua
(SA003965X) 
46
(2/27/2012) 
N.A0.650 0.350 
SouthAmerica Quechua
(SA000069P) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.652 0.348 
SouthAmerica Surui
(SA001515M) 
42
(11/4/2010) 
N.A0.570 0.430 
SouthAmerica Surui
(SA004390Q) 
46
(2/17/2016) 
N.A0.630 0.370 
SouthAmerica Ticuna
(SA003956X) 
50
(2/27/2012) 
N.A0.480 0.520 
SouthAmerica Ticuna
(SA004389Y) 
68
(2/17/2016) 
N.A0.471 0.529 

Total Population Samples 170
Total Alleles: 2


© 2019 Kenneth K Kidd, Yale University. All rights reserved. The full Copyright Notification is also available.
Originally prototyped by Michael Osier with the aid of Kei Cheung
Upgrades and maintenance since 2002 by Haseena Rajeevan